18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2159 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2159  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1578  CsbD family protein  79.27 
 
 		 82 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0515828  normal  0.510488 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2059  CsbD family protein  79.27 
 
 		 82 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3681  CsbD family protein  79.27 
 
 		 82 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5643  CsbD family protein  38.75 
 
 		 80 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1145  CsbD family protein  42.37 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3352  hypothetical protein  40.68 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2412  CsbD family protein  37.29 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.324054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2645  CsbD-like  46.3 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2598  hypothetical protein  34.67 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.110866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2001  CsbD family protein  38.98 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.992025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1689  CsbD family protein  44 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.368224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0610  hypothetical protein  30.49 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0057785 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3279  CsbD family protein  42 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5331  CsbD family protein  40 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107466 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1550  CsbD family protein  40.82 
 
 		 62 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0886434  normal  0.217022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1879  CsbD family protein  40.82 
 
 		 62 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  42 
 
 		 61 aa  40.4  0.008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>