69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3279 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3279  CsbD family protein  100 
 
 		 61 aa  117  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2412  CsbD family protein  75.86 
 
 		 59 aa  91.3  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.324054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3473  CsbD family protein  80.7 
 
 		 59 aa  90.9  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  65.57 
 
 		 61 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3274  CsbD-like  59.65 
 
 		 69 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2645  CsbD-like  57.38 
 
 		 61 aa  67.4  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2139  CsbD family protein  55 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756124  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2126  CsbD family protein  53.33 
 
 		 61 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0258887  normal  0.693221 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  48.33 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2201  hypothetical protein  45.61 
 
 		 71 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3572  CsbD-like  44.26 
 
 		 65 aa  50.1  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  42.37 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  42.37 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  42.37 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3895  CsbD family protein  45.45 
 
 		 58 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1706  CsbD family protein  41.82 
 
 		 58 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0926175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  43.1 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5280  CsbD-like  43.64 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5578  CsbD family protein  43.64 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.675487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3352  hypothetical protein  48.21 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  43.1 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  40.68 
 
 		 67 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1689  CsbD family protein  45.61 
 
 		 57 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.368224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5643  CsbD family protein  48 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1145  CsbD family protein  48.21 
 
 		 63 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4077  CsbD-like  43.86 
 
 		 71 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4455  CsbD family protein  37.5 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2423  CsbD family protein  33.33 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2060  CsbD-like  45.61 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2023  CsbD-like protein  42.31 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1879  CsbD family protein  41.07 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2202  CsbD-like  40.98 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0398  CsbD family protein  35.71 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1550  CsbD family protein  41.07 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0886434  normal  0.217022 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0604  protein YjbJ  42.37 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1855  CsbD family protein  42.31 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.268562  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1940  CsbD family protein  42.31 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0364  CsbD family protein  32.79 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0395  CsbD family protein  32.79 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0279  CsbD family protein  29.51 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1052  CsbD family protein  35.71 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.250631 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1394  CsbD-like  40.68 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  38.18 
 
 		 74 aa  42.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2184  CsbD family protein  37.74 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4184  CsbD family protein  32.79 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.432909 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0071  CsbD family protein  37.29 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.839575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  40.35 
 
 		 62 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5383  CsbD family protein  32.14 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184351 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5008  putative stress response protein  37.93 
 
 		 67 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594751  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0367  CsbD family protein  33.93 
 
 		 127 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5331  CsbD family protein  42.86 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107466 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3481  CsbD family protein  31.67 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258036  normal  0.179783 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2159  hypothetical protein  42 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1374  CsbD-like  40.68 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0616  CsbD family protein  40 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.396611  normal  0.591688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6209  CsbD family protein  31.15 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5455  hypothetical protein  38.46 
 
 		 65 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62680  hypothetical protein  38.46 
 
 		 65 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1055  CsbD family protein  33.33 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.120692 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1578  CsbD family protein  34.48 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0515828  normal  0.510488 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0658  CsbD family protein  40 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2651  CsbD-like protein  37.7 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6962  hypothetical protein  35.59 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2337  hypothetical protein  51.52 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.042061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5268  CsbD family protein  27.87 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0240  CsbD family protein  35.09 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.630063 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4905  CsbD family protein  36.21 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.5432  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4729  CsbD family protein  27.87 
 
 		 118 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  40.35 
 
 		 67 aa  40  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>