56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0240 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0240  CsbD family protein  100 
 
 		 113 aa  229  1e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.630063 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6962  hypothetical protein  35.45 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0395  CsbD family protein  29.73 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0364  CsbD family protein  29.73 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1055  CsbD family protein  29.73 
 
 		 113 aa  62  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.120692 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2107  CsbD family protein  36.89 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5268  CsbD family protein  34.19 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5383  CsbD family protein  30.36 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4729  CsbD family protein  32.48 
 
 		 118 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1539  CsbD family protein  28.57 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5196  CsbD family protein  32.48 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3914  CsbD family protein  26.89 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  44.83 
 
 		 61 aa  56.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3481  CsbD family protein  27.64 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258036  normal  0.179783 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2423  CsbD family protein  29.59 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  41.82 
 
 		 74 aa  50.4  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0279  CsbD family protein  27.93 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3274  CsbD-like  33.85 
 
 		 69 aa  48.9  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2718  CsbD family protein  28.42 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229668  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2495  CsbD family protein  28.42 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.282407 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4455  CsbD family protein  28.05 
 
 		 131 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2645  CsbD-like  39.66 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2202  CsbD-like  37.31 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  41.82 
 
 		 57 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  36.36 
 
 		 57 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2126  CsbD family protein  39.29 
 
 		 61 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0258887  normal  0.693221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2412  hypothetical protein  29.33 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2412  CsbD family protein  36.21 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.324054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4008  CsbD-like  36.36 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0235729  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  36.36 
 
 		 55 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6005  hypothetical protein  36.36 
 
 		 65 aa  42.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5380  CsbD family protein  27.93 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1394  CsbD-like  38.1 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1194  CsbD-like  36.36 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0398  CsbD family protein  35.71 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  38.18 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1196  CsbD-like  36.36 
 
 		 72 aa  42  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2139  CsbD family protein  38.6 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756124  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6209  CsbD family protein  26.88 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2679  hypothetical protein  36.36 
 
 		 63 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1052  CsbD family protein  33.93 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.250631 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5643  CsbD family protein  31.13 
 
 		 80 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0367  CsbD family protein  33.93 
 
 		 127 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3505  CsbD-like  37.5 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00399435  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0649  hypothetical protein  35.37 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0408075  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3387  CsbD family protein  39.29 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3710  CsbD family protein  39.29 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3415  CsbD family protein  34.55 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4048  CsbD family protein  32.76 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3279  CsbD family protein  35.09 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3473  CsbD family protein  32.76 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5248  CsbD family protein  34.55 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489032  normal  0.455845 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  34.92 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2651  CsbD-like protein  33.8 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  34.55 
 
 		 57 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5644  CsbD family protein  32.73 
 
 		 60 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.905021  normal  0.970955 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>