54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2201 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2201  hypothetical protein  100 
 
 		 71 aa  134  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4077  CsbD-like  77.46 
 
 		 71 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  70.42 
 
 		 71 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  69.01 
 
 		 71 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4905  CsbD family protein  70.42 
 
 		 71 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.5432  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2997  CsbD-like protein  80.28 
 
 		 71 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1079  CsbD-like  76.06 
 
 		 71 aa  82  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0315456  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0071  CsbD family protein  62.3 
 
 		 63 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.839575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4351  CsbD-like  57.14 
 
 		 63 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5381  CsbD family protein  53.52 
 
 		 67 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  58.06 
 
 		 67 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  53.23 
 
 		 67 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  53.23 
 
 		 67 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3782  CsbD-like  52.38 
 
 		 63 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.45663  normal  0.0243288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  53.23 
 
 		 67 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1596  hypothetical protein  54.1 
 
 		 63 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.446772  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  50.77 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236327 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  50.77 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5653  CsbD family protein  49.23 
 
 		 67 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4456  CsbD family protein  49.23 
 
 		 67 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.966914 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  50.77 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3861  CsbD family protein  52.63 
 
 		 59 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2156  CsbD family protein  51.79 
 
 		 59 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.703881 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0616  CsbD family protein  52.46 
 
 		 63 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.396611  normal  0.591688 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02330  CsbD-like stress response protein  49.21 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0752085  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4561  CsbD family protein  52.63 
 
 		 59 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1328  CsbD family protein  50.88 
 
 		 59 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0658  CsbD family protein  50.82 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4068  CsbD family protein  50.88 
 
 		 59 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3279  CsbD family protein  45.61 
 
 		 61 aa  50.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1434  CsbD-like protein  50 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2139  CsbD family protein  46.3 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756124  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0545  hypothetical protein  53.85 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  44.83 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  42.86 
 
 		 61 aa  45.4  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  42.86 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2107  CsbD family protein  40.91 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2126  CsbD family protein  44.44 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0258887  normal  0.693221 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  46.15 
 
 		 57 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2412  CsbD family protein  45.45 
 
 		 59 aa  45.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.324054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1858  CsbD family protein  40.35 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6977  hypothetical protein  40.35 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1345  CsbD family protein  36.84 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3473  CsbD family protein  41.82 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5268  CsbD family protein  36.51 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1332  CsbD-like  47.17 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00134797  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  41.07 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  46.15 
 
 		 57 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  44.23 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  42.31 
 
 		 57 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  40.38 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0279  CsbD family protein  38.6 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4729  CsbD family protein  34.92 
 
 		 118 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1786  CsbD family protein  46.15 
 
 		 70 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30394  normal  0.432294 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>