55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0616 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0616  CsbD family protein  100 
 
 		 63 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.396611  normal  0.591688 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0658  CsbD family protein  98.41 
 
 		 63 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1596  hypothetical protein  58.73 
 
 		 63 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.446772  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3782  CsbD-like  61.29 
 
 		 63 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.45663  normal  0.0243288 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02330  CsbD-like stress response protein  56.45 
 
 		 63 aa  67.8  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0752085  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4351  CsbD-like  58.06 
 
 		 63 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4905  CsbD family protein  53.97 
 
 		 71 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.5432  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  53.97 
 
 		 71 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  54.84 
 
 		 71 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4077  CsbD-like  52.17 
 
 		 71 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1079  CsbD-like  60 
 
 		 71 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0315456  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2997  CsbD-like protein  58.49 
 
 		 71 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2156  CsbD family protein  59.26 
 
 		 59 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.703881 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  52.38 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2201  hypothetical protein  52.46 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  49.18 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  49.18 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0071  CsbD family protein  49.21 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.839575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1434  CsbD-like protein  51.79 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1332  CsbD-like  53.57 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00134797  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  47.62 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5653  CsbD family protein  49.21 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4456  CsbD family protein  49.21 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.966914 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3861  CsbD family protein  50.88 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  46.03 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  44.44 
 
 		 67 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  44.83 
 
 		 62 aa  50.4  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  46.03 
 
 		 67 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4561  CsbD family protein  49.12 
 
 		 59 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5381  CsbD family protein  44.44 
 
 		 67 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1328  CsbD family protein  49.12 
 
 		 59 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4068  CsbD family protein  49.12 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  45 
 
 		 61 aa  47  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4184  CsbD family protein  40.68 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.432909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  43.4 
 
 		 57 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2561  CsbD family protein  43.64 
 
 		 56 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  44.23 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1384  CsbD family protein  45.28 
 
 		 59 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  43.86 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2423  CsbD family protein  36.84 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  41.51 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1078  CsbD family protein  46.15 
 
 		 56 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3862  CsbD family protein  37.7 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0951  CsbD family protein  39.62 
 
 		 124 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3279  CsbD family protein  40 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2222  CsbD family protein  37.93 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0127575 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  43.4 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  39.62 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0545  hypothetical protein  44.26 
 
 		 59 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2052  CsbD family protein  39.66 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1539  CsbD family protein  39.58 
 
 		 120 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1786  CsbD family protein  40.74 
 
 		 70 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30394  normal  0.432294 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0279  CsbD family protein  35.09 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0195  CsbD family protein  44.23 
 
 		 57 aa  40  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1345  CsbD family protein  38.6 
 
 		 60 aa  40  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>