121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2136 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  100 
 
 		 67 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  100 
 
 		 67 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  86.57 
 
 		 67 aa  110  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  79.1 
 
 		 67 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  75.76 
 
 		 67 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5381  CsbD family protein  71.64 
 
 		 67 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  74.24 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  71.21 
 
 		 67 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4456  CsbD family protein  69.7 
 
 		 67 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.966914 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5653  CsbD family protein  69.7 
 
 		 67 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0071  CsbD family protein  72.13 
 
 		 63 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.839575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3782  CsbD-like  63.93 
 
 		 63 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.45663  normal  0.0243288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  63.93 
 
 		 71 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1596  hypothetical protein  63.49 
 
 		 63 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.446772  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  57.14 
 
 		 71 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3861  CsbD family protein  63.16 
 
 		 59 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4351  CsbD-like  60.66 
 
 		 63 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1328  CsbD family protein  66.67 
 
 		 59 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4068  CsbD family protein  66.67 
 
 		 59 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4905  CsbD family protein  57.14 
 
 		 71 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.5432  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4561  CsbD family protein  64.91 
 
 		 59 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4077  CsbD-like  57.38 
 
 		 71 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1079  CsbD-like  64 
 
 		 71 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0315456  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2201  hypothetical protein  53.23 
 
 		 71 aa  65.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2997  CsbD-like protein  59.26 
 
 		 71 aa  60.8  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2156  CsbD family protein  53.57 
 
 		 59 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.703881 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  50 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02330  CsbD-like stress response protein  49.18 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0752085  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  51.72 
 
 		 61 aa  57.8  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0616  CsbD family protein  49.18 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.396611  normal  0.591688 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0941  CsbD family protein  54.39 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455689 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1219  CsbD-like  50 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0951  CsbD family protein  51.92 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0658  CsbD family protein  47.54 
 
 		 63 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  53.85 
 
 		 55 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  46.15 
 
 		 57 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0279  CsbD family protein  38.71 
 
 		 109 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3380  CsbD family protein  46.67 
 
 		 64 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.579569 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3194  CsbD family protein  48.08 
 
 		 101 aa  50.4  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.828188  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5268  CsbD family protein  38.98 
 
 		 118 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  41.07 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  50 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3279  CsbD family protein  42.37 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5651  CsbD family protein  38.71 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3147  CsbD family protein  48.08 
 
 		 56 aa  48.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6962  hypothetical protein  41.38 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0364  CsbD family protein  42.37 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4729  CsbD family protein  40.68 
 
 		 118 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6977  hypothetical protein  37.7 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0395  CsbD family protein  42.37 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1434  CsbD-like protein  50 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2412  CsbD family protein  45.45 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.324054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2861  CsbD family protein  41.54 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304574  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  44.23 
 
 		 57 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1858  CsbD family protein  39.62 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5196  CsbD family protein  38.98 
 
 		 118 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401648 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3862  CsbD family protein  37.31 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1332  CsbD-like  44.83 
 
 		 60 aa  47  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00134797  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5383  CsbD family protein  39.29 
 
 		 114 aa  47  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184351 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1353  CsbD family protein  40 
 
 		 71 aa  47  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43261e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3743  hypothetical protein  45.9 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1574  hypothetical protein  45.9 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222818  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3655  hypothetical protein  50.98 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3424  hypothetical protein  50.98 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.963083  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3694  hypothetical protein  50.98 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367193  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4993  CsbD family protein  46.15 
 
 		 57 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3320  CsbD family protein  49.02 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525397  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2423  CsbD family protein  38.6 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3644  hypothetical protein  50.98 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1221  hypothetical protein  44.44 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000483184  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  42.86 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3114  CsbD family protein  48.08 
 
 		 59 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0661187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  40.38 
 
 		 57 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3336  hypothetical protein  50.98 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2645  CsbD-like  39.29 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3274  CsbD-like  38.33 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2139  CsbD family protein  35.59 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756124  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6209  CsbD family protein  36.21 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5644  CsbD family protein  40.32 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.905021  normal  0.970955 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1055  CsbD family protein  38.6 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.120692 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3385  hypothetical protein  49.02 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00837674  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0295  CsbD family protein  36.92 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  40.38 
 
 		 57 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4611  CsbD family protein  41.82 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279751  normal  0.170316 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3666  hypothetical protein  49.02 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0579437  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2405  CsbD family protein  44.23 
 
 		 59 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.448422  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1539  CsbD family protein  41.82 
 
 		 120 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0156  hypothetical protein  34.48 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.232255  hitchhiker  0.0000211903 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2319  CsbD family protein  42 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2126  CsbD family protein  38.89 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0258887  normal  0.693221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2686  CsbD family protein  53.49 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0451307  normal  0.845965 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2184  CsbD family protein  41.51 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0649  hypothetical protein  43.94 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0408075  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2495  CsbD family protein  35.71 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.282407 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0452  CsbD family protein  39.22 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2718  CsbD family protein  35.71 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229668  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1374  CsbD-like  36.51 
 
 		 66 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1384  CsbD family protein  41.51 
 
 		 59 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4678  CsbD-like  38.98 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0166  CsbD-like  34.48 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.115396  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>