59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0279 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0279  CsbD family protein  100 
 
 		 109 aa  215  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6209  CsbD family protein  84.4 
 
 		 109 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0395  CsbD family protein  69.91 
 
 		 113 aa  148  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0364  CsbD family protein  69.91 
 
 		 124 aa  147  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2423  CsbD family protein  71.58 
 
 		 110 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1055  CsbD family protein  63.72 
 
 		 113 aa  130  9e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.120692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2495  CsbD family protein  66.32 
 
 		 110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.282407 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2718  CsbD family protein  66.32 
 
 		 110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229668  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5383  CsbD family protein  66.36 
 
 		 114 aa  117  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5268  CsbD family protein  54.39 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3481  CsbD family protein  47.93 
 
 		 125 aa  104  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258036  normal  0.179783 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4729  CsbD family protein  51.75 
 
 		 118 aa  103  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5196  CsbD family protein  50.88 
 
 		 118 aa  101  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401648 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4458  CsbD family protein  41.1 
 
 		 167 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5651  CsbD family protein  41.1 
 
 		 167 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6962  hypothetical protein  39.81 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1539  CsbD family protein  40.52 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3914  CsbD family protein  38.39 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4905  CsbD family protein  44.07 
 
 		 71 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.5432  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  38.71 
 
 		 67 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  38.71 
 
 		 67 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  47.54 
 
 		 71 aa  50.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  38.71 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  40.32 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2645  CsbD-like  37.7 
 
 		 61 aa  48.9  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  36.07 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  35.48 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  41.82 
 
 		 55 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4077  CsbD-like  40.58 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2107  CsbD family protein  43.1 
 
 		 126 aa  45.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  33.87 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0071  CsbD family protein  38.98 
 
 		 63 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.839575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4456  CsbD family protein  37.1 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.966914 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5653  CsbD family protein  37.1 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2412  CsbD family protein  33.33 
 
 		 59 aa  43.9  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.324054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4351  CsbD-like  36.21 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  33.87 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0649  hypothetical protein  38.81 
 
 		 75 aa  42.7  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0408075  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3279  CsbD family protein  29.51 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  35 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236327 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5653  CsbD family protein  37.5 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  36.36 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2220  hypothetical protein  41.51 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0951  CsbD family protein  38.18 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3194  CsbD family protein  38.6 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.828188  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5380  CsbD family protein  33.33 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3274  CsbD-like  29.69 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2156  CsbD family protein  40.38 
 
 		 59 aa  42  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.703881 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1221  hypothetical protein  40 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000483184  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1596  hypothetical protein  35.59 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.446772  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0941  CsbD family protein  39.68 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455689 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3147  CsbD family protein  39.29 
 
 		 56 aa  40.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6977  hypothetical protein  34.48 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1858  CsbD family protein  34.48 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1219  CsbD-like  37.04 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0616  CsbD family protein  35.09 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.396611  normal  0.591688 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2095  hypothetical protein  28.68 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5985  hypothetical protein  39.62 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.425207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2201  hypothetical protein  38.6 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>