50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2718 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2495  CsbD family protein  100 
 
 		 110 aa  217  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.282407 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2718  CsbD family protein  100 
 
 		 110 aa  217  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229668  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2423  CsbD family protein  83.64 
 
 		 110 aa  166  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0279  CsbD family protein  68.87 
 
 		 109 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0364  CsbD family protein  69.37 
 
 		 124 aa  141  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0395  CsbD family protein  69.37 
 
 		 113 aa  141  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1055  CsbD family protein  68.18 
 
 		 113 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.120692 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6209  CsbD family protein  69.47 
 
 		 109 aa  134  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5383  CsbD family protein  66.37 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184351 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5268  CsbD family protein  52.99 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5196  CsbD family protein  51.28 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401648 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3481  CsbD family protein  48.39 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258036  normal  0.179783 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4729  CsbD family protein  50.43 
 
 		 118 aa  100  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5651  CsbD family protein  43.03 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4458  CsbD family protein  43.03 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6962  hypothetical protein  43.64 
 
 		 122 aa  90.1  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1539  CsbD family protein  45.38 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3914  CsbD family protein  34.75 
 
 		 116 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  47.17 
 
 		 55 aa  52  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  35 
 
 		 61 aa  47.8  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  35.21 
 
 		 74 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0240  CsbD family protein  27.85 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.630063 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4184  CsbD family protein  34.38 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.432909 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4698  CsbD family protein  32.81 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328143  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6977  hypothetical protein  36.21 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4825  hypothetical protein  38.24 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0379689  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1858  CsbD family protein  36.21 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2569  hypothetical protein  36.76 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3194  CsbD family protein  40.35 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.828188  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2107  CsbD family protein  29.92 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03817  protein YjbJ  31.75 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3147  CsbD family protein  41.07 
 
 		 56 aa  42.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0795  CsbD family protein  30 
 
 		 73 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  35.71 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2220  hypothetical protein  26.73 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  35.71 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2288  CsbD family protein  29.69 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0240  CsbD family protein  39.06 
 
 		 73 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.9917 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3988  CsbD-like  29.69 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4154  CsbD-like  29.69 
 
 		 69 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1698  CsbD family protein  30.16 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2645  CsbD-like  35 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2245  CsbD-like protein  29.03 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1645  CsbD family protein  30.65 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224689  normal  0.344043 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  35.71 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5643  CsbD family protein  28.57 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1052  CsbD family protein  31.2 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.250631 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5644  CsbD family protein  36.36 
 
 		 60 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.905021  normal  0.970955 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1731  CsbD-like  28.12 
 
 		 65 aa  40  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.888491  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4905  CsbD family protein  40.35 
 
 		 71 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.5432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>