99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6977 on replicon NC_010373
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010373  M446_6977  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1858  CsbD family protein  98.53 
 
 		 68 aa  130  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  64.81 
 
 		 57 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  64.81 
 
 		 57 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  57.41 
 
 		 57 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  59.26 
 
 		 57 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  57.41 
 
 		 55 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0951  CsbD family protein  57.41 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3194  CsbD family protein  48.21 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.828188  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  43.75 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3147  CsbD family protein  50 
 
 		 56 aa  59.7  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  44.26 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1219  CsbD-like  45.76 
 
 		 72 aa  55.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2679  hypothetical protein  42.62 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5644  CsbD family protein  42.59 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.905021  normal  0.970955 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4048  CsbD family protein  42.62 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  44.07 
 
 		 62 aa  55.1  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5248  CsbD family protein  42.62 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489032  normal  0.455845 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3415  CsbD family protein  42.62 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0941  CsbD family protein  48.21 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455689 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3473  CsbD family protein  39.34 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5153  CsbD family protein  37.1 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.587859 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  46.3 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  40.98 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4905  CsbD family protein  46.3 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.5432  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3743  hypothetical protein  35.48 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1574  hypothetical protein  35.48 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222818  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3114  CsbD family protein  50 
 
 		 59 aa  48.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0661187 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  37.7 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  37.7 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1345  CsbD family protein  40 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3385  hypothetical protein  34.92 
 
 		 70 aa  48.1  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00837674  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0974  CsbD family protein  42.86 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000000559143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3694  hypothetical protein  34.92 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367193  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3644  hypothetical protein  34.92 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3424  hypothetical protein  34.92 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.963083  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3655  hypothetical protein  37.04 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  38.6 
 
 		 61 aa  47  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3336  hypothetical protein  33.33 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1394  CsbD-like  42.19 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3320  CsbD family protein  37.04 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525397  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4077  CsbD-like  42.59 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5383  CsbD family protein  37.93 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184351 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0071  CsbD family protein  46.15 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.839575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4698  CsbD family protein  39.68 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328143  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4184  CsbD family protein  40.74 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.432909 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3666  hypothetical protein  37.04 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0579437  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0156  hypothetical protein  46.81 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.232255  hitchhiker  0.0000211903 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  37.5 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7336  CsbD family protein  42.59 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2491  CsbD family protein  39.68 
 
 		 68 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.853638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2107  CsbD family protein  42.59 
 
 		 126 aa  44.7  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0166  CsbD-like  46.81 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.115396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0364  CsbD family protein  41.07 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2495  CsbD family protein  37.5 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.282407 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2718  CsbD family protein  37.5 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229668  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6209  CsbD family protein  35.59 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0987  hypothetical protein  42.59 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0395  CsbD family protein  41.07 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1063  hypothetical protein  42.59 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4306299999999999e-37 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2201  hypothetical protein  40.35 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0891  hypothetical protein  42.59 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0923  hypothetical protein  42.59 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0908  hypothetical protein  42.59 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000630947  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1154  hypothetical protein  42.59 
 
 		 66 aa  43.5  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2423  CsbD family protein  37.5 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1683  CsbD family protein  42.11 
 
 		 60 aa  43.5  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000685848  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1716  CsbD family protein  42.11 
 
 		 60 aa  43.5  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000823848  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2997  CsbD-like protein  45.83 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0316  CsbD family protein  37.74 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.179189  hitchhiker  0.0000000572285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2861  CsbD family protein  33.87 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304574  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3610  CsbD family protein  42.86 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0252527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1055  CsbD family protein  39.29 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.120692 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3572  CsbD-like  35.09 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2288  CsbD family protein  40.74 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  38.89 
 
 		 71 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1539  CsbD family protein  40.38 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1931  CsbD family protein  38.18 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.403244 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4351  CsbD-like  42.31 
 
 		 63 aa  42  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4727  CsbD family protein  40.74 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781625  hitchhiker  0.00687348 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4275  hypothetical protein  37.5 
 
 		 66 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.186027  hitchhiker  0.00765973 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1079  CsbD-like  46.67 
 
 		 71 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0315456  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1136  hypothetical protein  34.62 
 
 		 65 aa  41.2  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00391813  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2245  CsbD-like protein  41.54 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1374  CsbD-like  40.38 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2503  CsbD-like  43.4 
 
 		 91 aa  41.2  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0483582  normal  0.747917 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1860  CsbD family protein  33.96 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0325591  normal  0.0799558 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1706  CsbD family protein  33.33 
 
 		 58 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0926175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0279  CsbD family protein  34.48 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1081  hypothetical protein  38.89 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0055  CsbD family protein  40 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587208 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3263  CsbD family protein  39.62 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1152  CsbD-like  31.82 
 
 		 73 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3481  CsbD family protein  37.93 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258036  normal  0.179783 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0857  CsbD family protein  40.35 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00154201  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0841  CsbD family protein  40.35 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00257434  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2184  CsbD family protein  35.19 
 
 		 59 aa  40.4  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2910  hypothetical protein  43.86 
 
 		 79 aa  40  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.912456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0898  CsbD family protein  37.04 
 
 		 66 aa  40  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>