49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3481 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3481  CsbD family protein  100 
 
 		 125 aa  240  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258036  normal  0.179783 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5268  CsbD family protein  63.2 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4729  CsbD family protein  61.6 
 
 		 118 aa  143  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5196  CsbD family protein  60.8 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401648 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5383  CsbD family protein  61.6 
 
 		 114 aa  123  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184351 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0395  CsbD family protein  57.85 
 
 		 113 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0364  CsbD family protein  57.85 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1055  CsbD family protein  57.02 
 
 		 113 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.120692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0279  CsbD family protein  47.93 
 
 		 109 aa  104  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6962  hypothetical protein  42.98 
 
 		 122 aa  94.7  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6209  CsbD family protein  52.87 
 
 		 109 aa  94  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2423  CsbD family protein  52.87 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2718  CsbD family protein  45.45 
 
 		 110 aa  84  7e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229668  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2495  CsbD family protein  45.45 
 
 		 110 aa  84  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.282407 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1539  CsbD family protein  41.73 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4458  CsbD family protein  42.77 
 
 		 167 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5651  CsbD family protein  42.77 
 
 		 167 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3914  CsbD family protein  38.71 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2107  CsbD family protein  35.2 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4456  CsbD family protein  44.83 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.966914 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5653  CsbD family protein  44.83 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  40.32 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  43.1 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236327 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  41.38 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  41.38 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  37.7 
 
 		 61 aa  45.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2095  hypothetical protein  29.29 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6818  hypothetical protein  36.36 
 
 		 272 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  43.86 
 
 		 62 aa  45.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4077  CsbD-like  39.66 
 
 		 71 aa  43.5  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  34.21 
 
 		 74 aa  43.5  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5380  CsbD family protein  31.2 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0951  CsbD family protein  38.18 
 
 		 124 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2220  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3279  CsbD family protein  31.67 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4905  CsbD family protein  38.6 
 
 		 71 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.5432  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3194  CsbD family protein  39.29 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.828188  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2139  CsbD family protein  35.09 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756124  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  36.84 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4163  hypothetical protein  35.29 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0649  hypothetical protein  38.03 
 
 		 75 aa  40.4  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0408075  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2156  CsbD family protein  42 
 
 		 59 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.703881 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  40.38 
 
 		 55 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6977  hypothetical protein  37.93 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1858  CsbD family protein  37.93 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4184  CsbD family protein  34.92 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.432909 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0184  hypothetical protein  38.89 
 
 		 261 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0795  CsbD family protein  31.43 
 
 		 73 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3865  late embryogenesis abundant protein  28.75 
 
 		 136 aa  40  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.278671  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>