75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6962 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6962  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  243  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1055  CsbD family protein  45.87 
 
 		 113 aa  103  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.120692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0395  CsbD family protein  46.79 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0364  CsbD family protein  46.79 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3481  CsbD family protein  42.98 
 
 		 125 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258036  normal  0.179783 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1539  CsbD family protein  43.59 
 
 		 120 aa  89  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5268  CsbD family protein  42.74 
 
 		 118 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3914  CsbD family protein  40.71 
 
 		 116 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5383  CsbD family protein  44.55 
 
 		 114 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184351 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4729  CsbD family protein  40.17 
 
 		 118 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5196  CsbD family protein  39.32 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401648 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2718  CsbD family protein  42.86 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229668  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2495  CsbD family protein  42.86 
 
 		 110 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.282407 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0279  CsbD family protein  39.81 
 
 		 109 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2423  CsbD family protein  41.84 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6209  CsbD family protein  37.76 
 
 		 109 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5643  CsbD family protein  36.7 
 
 		 80 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  47.46 
 
 		 61 aa  60.5  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2107  CsbD family protein  34.92 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  49.09 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0240  CsbD family protein  32.61 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.630063 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4458  CsbD family protein  29.19 
 
 		 167 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5651  CsbD family protein  29.19 
 
 		 167 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2598  hypothetical protein  46.43 
 
 		 90 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.110866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2220  hypothetical protein  46.67 
 
 		 95 aa  50.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  41.38 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  41.38 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3194  CsbD family protein  42.86 
 
 		 101 aa  48.1  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.828188  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2679  hypothetical protein  43.64 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3147  CsbD family protein  42.86 
 
 		 56 aa  47.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3274  CsbD-like  34.92 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2645  CsbD-like  38.98 
 
 		 61 aa  47.8  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  41.82 
 
 		 57 aa  47  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4048  CsbD family protein  41.82 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5985  hypothetical protein  43.33 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.425207 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2412  CsbD family protein  40.35 
 
 		 59 aa  47  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.324054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3473  CsbD family protein  41.82 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5644  CsbD family protein  43.64 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.905021  normal  0.970955 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  37.93 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  39.62 
 
 		 55 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4184  CsbD family protein  34.92 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.432909 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5248  CsbD family protein  38.18 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489032  normal  0.455845 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0649  hypothetical protein  39.02 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0408075  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  40 
 
 		 57 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  36.84 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  40 
 
 		 57 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3415  CsbD family protein  38.18 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2139  CsbD family protein  35.09 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756124  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3473  CsbD family protein  38.6 
 
 		 59 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5153  CsbD family protein  40 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.587859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  37.1 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  40 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03817  protein YjbJ  36.67 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1219  CsbD-like  40.35 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0848  CsbD family protein  38.89 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00395156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2126  CsbD family protein  35.09 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0258887  normal  0.693221 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1578  CsbD family protein  22.73 
 
 		 82 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0515828  normal  0.510488 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1698  CsbD family protein  33.33 
 
 		 69 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0604  protein YjbJ  31.75 
 
 		 65 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1092  hypothetical protein  37.04 
 
 		 68 aa  41.2  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3988  CsbD-like  35.59 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2001  CsbD family protein  38.89 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.992025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  38.6 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  37.1 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3279  CsbD family protein  35.59 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4611  CsbD family protein  28.07 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279751  normal  0.170316 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0644  hypothetical protein  40.91 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.624559  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5381  CsbD family protein  37.93 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  38.6 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4486  CsbD family protein  35.71 
 
 		 60 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7336  CsbD family protein  35.59 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4905  CsbD family protein  39.29 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.5432  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2651  CsbD-like protein  35 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4727  CsbD family protein  33.33 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781625  hitchhiker  0.00687348 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2052  CsbD family protein  39.29 
 
 		 61 aa  40  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>