89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5644 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5644  CsbD family protein  100 
 
 		 60 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.905021  normal  0.970955 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3473  CsbD family protein  65.45 
 
 		 63 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4048  CsbD family protein  65.45 
 
 		 63 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2679  hypothetical protein  65.45 
 
 		 63 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5153  CsbD family protein  56.67 
 
 		 63 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.587859 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5248  CsbD family protein  63.64 
 
 		 63 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489032  normal  0.455845 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3415  CsbD family protein  63.64 
 
 		 63 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  54.55 
 
 		 55 aa  64.3  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  51.79 
 
 		 74 aa  63.9  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7336  CsbD family protein  48.28 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1858  CsbD family protein  42.59 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6977  hypothetical protein  42.59 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3194  CsbD family protein  49.09 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.828188  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3147  CsbD family protein  49.09 
 
 		 56 aa  54.3  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1698  CsbD family protein  44.83 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4154  CsbD-like  43.1 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4727  CsbD family protein  47.27 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781625  hitchhiker  0.00687348 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3988  CsbD-like  46.55 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2245  CsbD-like protein  43.1 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  42.11 
 
 		 57 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4184  CsbD family protein  40 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.432909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  40.35 
 
 		 57 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4698  CsbD family protein  44.83 
 
 		 66 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328143  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0951  CsbD family protein  45.61 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2288  CsbD family protein  39.66 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1345  CsbD family protein  46.67 
 
 		 60 aa  51.2  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  40.35 
 
 		 57 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1847  CsbD family protein  39.66 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.373794  normal  0.439054 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  40.35 
 
 		 57 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2405  CsbD family protein  51.06 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.448422  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1645  CsbD family protein  45.83 
 
 		 67 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224689  normal  0.344043 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2184  CsbD family protein  39.62 
 
 		 59 aa  46.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2651  CsbD-like protein  45.83 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  40 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1219  CsbD-like  36.67 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0941  CsbD family protein  45.45 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6962  hypothetical protein  43.64 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  40.32 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  40.32 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1394  CsbD-like  37.93 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3610  CsbD family protein  41.67 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0252527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4458  putative stress-response protein  37.29 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3320  CsbD family protein  39.62 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525397  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  40.38 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2491  CsbD family protein  36.21 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.853638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1196  CsbD-like  39.58 
 
 		 72 aa  44.3  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2316  CsbD family protein  44.9 
 
 		 59 aa  44.3  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1706  CsbD family protein  35.09 
 
 		 58 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0926175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1574  hypothetical protein  41.51 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222818  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3644  hypothetical protein  41.51 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3655  hypothetical protein  41.51 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3424  hypothetical protein  41.51 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.963083  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3572  CsbD-like  34.55 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3694  hypothetical protein  41.51 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367193  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3743  hypothetical protein  41.51 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5578  CsbD family protein  33.33 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.675487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5280  CsbD-like  33.33 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1194  CsbD-like  39.58 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5331  CsbD family protein  38.18 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107466 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3895  CsbD family protein  38.33 
 
 		 58 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5008  putative stress response protein  37.5 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594751  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3114  CsbD family protein  45.83 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0661187 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  40 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1374  CsbD-like  39.66 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3666  hypothetical protein  44.68 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0579437  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08871  CsbD-like protein  32.76 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.919038  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3274  CsbD-like  36.36 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0316  CsbD family protein  29.31 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.179189  hitchhiker  0.0000000572285 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3385  hypothetical protein  39.62 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00837674  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2861  CsbD family protein  41.18 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304574  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5653  CsbD family protein  48.78 
 
 		 59 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3336  hypothetical protein  41.51 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2645  CsbD-like  34.55 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0249  CsbD family protein  35.59 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.806241  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0254  CsbD family protein  35.59 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0514063 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03817  protein YjbJ  34.48 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1353  CsbD family protein  47.62 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43261e-22 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1268  CsbD-like  36.21 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3352  hypothetical protein  38.33 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1145  CsbD family protein  38.33 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5643  CsbD family protein  38.89 
 
 		 80 aa  41.2  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2423  CsbD family protein  38.18 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1136  hypothetical protein  29.09 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00391813  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0604  protein YjbJ  32.76 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03506  hypothetical protein  56.76 
 
 		 45 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2910  hypothetical protein  37.5 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.912456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2718  CsbD family protein  36.36 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229668  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2495  CsbD family protein  36.36 
 
 		 110 aa  40.4  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.282407 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0240  CsbD family protein  32.73 
 
 		 113 aa  40  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.630063 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>