83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0941 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0941  CsbD family protein  100 
 
 		 64 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455689 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  55.17 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5653  CsbD family protein  57.14 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4456  CsbD family protein  57.14 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.966914 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3320  CsbD family protein  62 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3424  hypothetical protein  62 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.963083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3644  hypothetical protein  62 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3694  hypothetical protein  62 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367193  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3666  hypothetical protein  63.27 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0579437  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3655  hypothetical protein  62 
 
 		 67 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3743  hypothetical protein  62 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1574  hypothetical protein  62 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222818  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  55.36 
 
 		 67 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3385  hypothetical protein  60 
 
 		 70 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00837674  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  55.36 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  54.39 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  54.39 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  54.39 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3336  hypothetical protein  60 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1219  CsbD-like  49.21 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6977  hypothetical protein  48.21 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1858  CsbD family protein  48.21 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0951  CsbD family protein  50.91 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5381  CsbD family protein  50 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  56.6 
 
 		 55 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3194  CsbD family protein  47.37 
 
 		 101 aa  51.2  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.828188  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1345  CsbD family protein  52.54 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  48.33 
 
 		 62 aa  50.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3147  CsbD family protein  48.21 
 
 		 56 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  49.06 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  47.17 
 
 		 57 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  45.28 
 
 		 57 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  45.28 
 
 		 57 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1136  hypothetical protein  38.1 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00391813  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  43.86 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5653  CsbD family protein  43.86 
 
 		 59 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5644  CsbD family protein  45.45 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.905021  normal  0.970955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  45.45 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0891  hypothetical protein  45.76 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3861  CsbD family protein  48.15 
 
 		 59 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0908  hypothetical protein  45.76 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000630947  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1063  hypothetical protein  45.76 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4306299999999999e-37 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0923  hypothetical protein  45.76 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0987  hypothetical protein  45.76 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  37.29 
 
 		 61 aa  44.3  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37400  CsbD-like protein  52 
 
 		 57 aa  44.3  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0215657  normal  0.523967 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2679  hypothetical protein  46.43 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1328  CsbD family protein  50 
 
 		 59 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1154  hypothetical protein  45.76 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1689  CsbD family protein  42.86 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.368224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4068  CsbD family protein  50 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4993  CsbD family protein  47.62 
 
 		 57 aa  42.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2060  CsbD-like  46.15 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3263  CsbD family protein  45.61 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5110  CsbD family protein  46.81 
 
 		 57 aa  42.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3380  CsbD family protein  45.61 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.579569 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1081  hypothetical protein  44.07 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1596  hypothetical protein  46.43 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.446772  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4698  CsbD family protein  40.68 
 
 		 66 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328143  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3114  CsbD family protein  46.94 
 
 		 59 aa  41.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0661187 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0295  CsbD family protein  49.06 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4561  CsbD family protein  48.15 
 
 		 59 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3782  CsbD-like  47.17 
 
 		 63 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.45663  normal  0.0243288 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0833  hypothetical protein  45.1 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000181755  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1716  CsbD family protein  47.06 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000823848  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1683  CsbD family protein  47.06 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000685848  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5236  CsbD family protein  55.26 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00387932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1628  CsbD family protein  44.23 
 
 		 55 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.462679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2686  CsbD family protein  53.66 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0451307  normal  0.845965 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0898  CsbD family protein  44.07 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0279  CsbD family protein  39.68 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0644  hypothetical protein  44.44 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.624559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4275  hypothetical protein  42.37 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.186027  hitchhiker  0.00765973 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1221  hypothetical protein  45.31 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000483184  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2405  CsbD family protein  47.73 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.448422  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11610  CsbD-like protein  45.28 
 
 		 58 aa  40.4  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.583154 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2245  CsbD-like protein  37.29 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4905  CsbD family protein  41.07 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.5432  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3345  CsbD family protein  41.38 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.97311  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0071  CsbD family protein  44.64 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.839575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4048  CsbD family protein  45.45 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7336  CsbD family protein  35.94 
 
 		 67 aa  40  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5383  CsbD family protein  41.67 
 
 		 114 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184351 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>