121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3415 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5248  CsbD family protein  100 
 
 		 63 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489032  normal  0.455845 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3415  CsbD family protein  100 
 
 		 63 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3473  CsbD family protein  88.89 
 
 		 63 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4048  CsbD family protein  88.89 
 
 		 63 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2679  hypothetical protein  85.71 
 
 		 63 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5153  CsbD family protein  74.19 
 
 		 63 aa  91.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.587859 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5644  CsbD family protein  63.64 
 
 		 60 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.905021  normal  0.970955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  50.79 
 
 		 74 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  58.18 
 
 		 55 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7336  CsbD family protein  54.55 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4698  CsbD family protein  51.79 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328143  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2245  CsbD-like protein  51.79 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4727  CsbD family protein  50 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781625  hitchhiker  0.00687348 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1858  CsbD family protein  42.62 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6977  hypothetical protein  42.62 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2491  CsbD family protein  45 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.853638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1698  CsbD family protein  50.91 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2910  hypothetical protein  48.33 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.912456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  42.11 
 
 		 57 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1847  CsbD family protein  50 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.373794  normal  0.439054 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4154  CsbD-like  41.38 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2288  CsbD family protein  44.64 
 
 		 66 aa  51.2  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3988  CsbD-like  44.64 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4184  CsbD family protein  46.55 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.432909 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3610  CsbD family protein  53.57 
 
 		 66 aa  50.4  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0252527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3194  CsbD family protein  44.64 
 
 		 101 aa  50.8  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.828188  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3147  CsbD family protein  44.64 
 
 		 56 aa  50.1  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5643  CsbD family protein  44.83 
 
 		 80 aa  50.1  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  43.64 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08871  CsbD-like protein  41.07 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.919038  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1645  CsbD family protein  46.43 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224689  normal  0.344043 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1374  CsbD-like  45.45 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  43.64 
 
 		 57 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1394  CsbD-like  44.44 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1706  CsbD family protein  35.09 
 
 		 58 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0926175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0249  putative stress-response protein  41.67 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.430539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4458  putative stress-response protein  50 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0848  CsbD family protein  43.94 
 
 		 68 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00395156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  43.64 
 
 		 57 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1092  hypothetical protein  43.94 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5280  CsbD-like  34.48 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1219  CsbD-like  41.82 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5578  CsbD family protein  34.48 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.675487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2052  CsbD family protein  48.08 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1786  CsbD family protein  36.84 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30394  normal  0.432294 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0316  CsbD family protein  37.04 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.179189  hitchhiker  0.0000000572285 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1345  CsbD family protein  42.59 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4507  putative stress-response protein  41.67 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1963  hypothetical protein  48 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.435104  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  44.07 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0951  CsbD family protein  43.64 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2316  CsbD family protein  50 
 
 		 59 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5157  CsbD family protein  43.86 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.461612 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03506  hypothetical protein  63.64 
 
 		 45 aa  45.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  38.18 
 
 		 61 aa  44.3  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6962  hypothetical protein  38.18 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6005  hypothetical protein  41.07 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1855  CsbD family protein  39.34 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.268562  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1940  CsbD family protein  39.34 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2683  hypothetical protein  48.08 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3468  CsbD family protein  43.86 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4053  CsbD family protein  43.86 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0249  CsbD family protein  48.21 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.806241  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2023  CsbD-like protein  39.34 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0604  protein YjbJ  37.93 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0254  CsbD family protein  48.21 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0514063 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0240  CsbD family protein  42.19 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.9917 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0619  hypothetical protein  44.44 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4486  CsbD family protein  41.51 
 
 		 60 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3387  CsbD family protein  47.92 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03917  predicted stress response protein  45.28 
 
 		 69 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3948  CsbD family protein  45.28 
 
 		 69 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3572  CsbD-like  40 
 
 		 65 aa  43.5  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2651  CsbD-like protein  36.67 
 
 		 68 aa  43.5  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4285  putative stress-response protein  45.28 
 
 		 69 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4598  putative stress-response protein  45.28 
 
 		 69 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03877  hypothetical protein  45.28 
 
 		 69 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3983  putative stress-response protein  45.28 
 
 		 69 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.216116 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4552  putative stress-response protein  45.28 
 
 		 69 aa  43.5  0.0009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3710  CsbD family protein  47.92 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5526  putative stress-response protein  45.28 
 
 		 69 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.289766  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1136  hypothetical protein  36.36 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00391813  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2250  hypothetical protein  38.33 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1194  CsbD-like  39.29 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1196  CsbD-like  39.29 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1851  CsbD family protein  35.71 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.668658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5243  CsbD family protein  41.38 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.723019 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2107  CsbD family protein  41.82 
 
 		 126 aa  42.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3411  CsbD family protein  41.38 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3895  CsbD family protein  31.58 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2892  CsbD family protein  47.92 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327354  normal  0.0609409 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4583  putative stress-response protein  43.4 
 
 		 70 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.808019 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4582  putative stress-response protein  43.4 
 
 		 70 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03817  protein YjbJ  37.93 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4497  putative stress-response protein  43.4 
 
 		 70 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4634  putative stress-response protein  43.4 
 
 		 70 aa  42.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.27716 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0515  putative stress-response protein  44 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62680  hypothetical protein  44 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0852  CsbD family protein  43.4 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5455  hypothetical protein  44 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>