113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1602 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  100 
 
 		 61 aa  112  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2645  CsbD-like  73.77 
 
 		 61 aa  84.3  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3274  CsbD-like  73.68 
 
 		 69 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3279  CsbD family protein  65.57 
 
 		 61 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2412  CsbD family protein  60.34 
 
 		 59 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.324054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3473  CsbD family protein  64.91 
 
 		 59 aa  68.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2139  CsbD family protein  54.39 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756124  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2126  CsbD family protein  54.39 
 
 		 61 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0258887  normal  0.693221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6962  hypothetical protein  47.46 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5331  CsbD family protein  53.45 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107466 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1219  CsbD-like  54.39 
 
 		 72 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  51.72 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  51.72 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0240  CsbD family protein  44.83 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.630063 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  48.28 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  50 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1689  CsbD family protein  52.63 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.368224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  43.64 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0398  CsbD family protein  41.38 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  48.28 
 
 		 71 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3572  CsbD-like  44.26 
 
 		 65 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3352  hypothetical protein  50 
 
 		 63 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1145  CsbD family protein  51.72 
 
 		 63 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0395  CsbD family protein  42.62 
 
 		 113 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2107  CsbD family protein  44.83 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0364  CsbD family protein  42.62 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4455  CsbD family protein  37.7 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0367  CsbD family protein  39.66 
 
 		 127 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5653  CsbD family protein  45.45 
 
 		 59 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4077  CsbD-like  49.12 
 
 		 71 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  52.63 
 
 		 71 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5643  CsbD family protein  51.85 
 
 		 80 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1786  CsbD family protein  43.64 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30394  normal  0.432294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1578  CsbD family protein  41.07 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0515828  normal  0.510488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  41.82 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2059  CsbD family protein  41.07 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2060  CsbD-like  46.55 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3194  CsbD family protein  45.45 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.828188  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3681  CsbD family protein  41.07 
 
 		 82 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0071  CsbD family protein  46.55 
 
 		 63 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.839575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  40 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  41.82 
 
 		 57 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1052  CsbD family protein  37.93 
 
 		 127 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.250631 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1055  CsbD family protein  38.33 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.120692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0279  CsbD family protein  36.07 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  52.63 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2423  CsbD family protein  36.67 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4905  CsbD family protein  44.83 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.5432  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  45.45 
 
 		 57 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6209  CsbD family protein  34.43 
 
 		 109 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3147  CsbD family protein  45.45 
 
 		 56 aa  47.4  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2495  CsbD family protein  36.84 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.282407 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2718  CsbD family protein  36.84 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229668  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1706  CsbD family protein  38.18 
 
 		 58 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0926175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62680  hypothetical protein  40 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5455  hypothetical protein  40 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21937  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  43.86 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2651  CsbD-like protein  40.98 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1550  CsbD family protein  46.67 
 
 		 62 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0886434  normal  0.217022 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5196  CsbD family protein  36.07 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401648 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3473  CsbD family protein  37.5 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4729  CsbD family protein  37.29 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5383  CsbD family protein  37.93 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184351 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4048  CsbD family protein  39.29 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3895  CsbD family protein  40 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5644  CsbD family protein  40 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.905021  normal  0.970955 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1879  CsbD family protein  46.67 
 
 		 62 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5268  CsbD family protein  35.59 
 
 		 118 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0616  CsbD family protein  45 
 
 		 63 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.396611  normal  0.591688 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5280  CsbD-like  38.18 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5578  CsbD family protein  38.18 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.675487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2201  hypothetical protein  42.86 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3468  CsbD family protein  50 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517698  normal  0.22069 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2679  hypothetical protein  38.18 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0604  protein YjbJ  42.37 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4184  CsbD family protein  31.15 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.432909 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6977  hypothetical protein  37.5 
 
 		 68 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1858  CsbD family protein  37.5 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5380  CsbD family protein  35.59 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  41.67 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0316  CsbD family protein  42.59 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.179189  hitchhiker  0.0000000572285 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  45.45 
 
 		 55 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5248  CsbD family protein  38.18 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489032  normal  0.455845 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0658  CsbD family protein  43.33 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3415  CsbD family protein  38.18 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2202  CsbD-like  40.98 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2023  CsbD-like protein  40.38 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  41.38 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4678  CsbD-like  44.23 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1394  CsbD-like  40.68 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2001  CsbD family protein  33.33 
 
 		 82 aa  42.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.992025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5153  CsbD family protein  31.67 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.587859 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1539  CsbD family protein  40 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  41.38 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236327 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1196  CsbD-like  39.34 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1374  CsbD-like  40.68 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3602  CsbD family protein  35.38 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.257437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  41.38 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1940  CsbD family protein  40.38 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1855  CsbD family protein  40.38 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.268562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>