87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2405 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2405  CsbD family protein  100 
 
 		 59 aa  111  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.448422  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2184  CsbD family protein  59.65 
 
 		 59 aa  71.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2861  CsbD family protein  56.36 
 
 		 71 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304574  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2316  CsbD family protein  61.02 
 
 		 59 aa  62.8  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1353  CsbD family protein  56.36 
 
 		 71 aa  62  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43261e-22 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3114  CsbD family protein  52.54 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0661187 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0452  CsbD family protein  47.27 
 
 		 59 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0468  CsbD family protein  47.27 
 
 		 59 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000124278 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3385  hypothetical protein  48 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00837674  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3782  CsbD-like  49.09 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.45663  normal  0.0243288 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3666  hypothetical protein  47.06 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0579437  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5644  CsbD family protein  51.06 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.905021  normal  0.970955 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3320  CsbD family protein  46 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3424  hypothetical protein  46 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.963083  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3655  hypothetical protein  46 
 
 		 67 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3694  hypothetical protein  46 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367193  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3743  hypothetical protein  46 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1574  hypothetical protein  46 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222818  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3644  hypothetical protein  46 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  48 
 
 		 62 aa  47  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5008  putative stress response protein  45.83 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594751  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4458  putative stress-response protein  50 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2060  CsbD-like  55.1 
 
 		 61 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1596  hypothetical protein  47.27 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.446772  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  46.15 
 
 		 55 aa  45.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4068  CsbD family protein  47.27 
 
 		 59 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7180  CsbD family protein  50 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141248  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4561  CsbD family protein  47.27 
 
 		 59 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1328  CsbD family protein  47.27 
 
 		 59 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5653  CsbD family protein  50 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4456  CsbD family protein  50 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.966914 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3387  CsbD family protein  43.75 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1698  CsbD family protein  44.44 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  44.23 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3710  CsbD family protein  43.75 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  44.23 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  44.23 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0494  hypothetical protein  50 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.109634  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4184  CsbD family protein  45.83 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.432909 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1332  CsbD-like  40.74 
 
 		 60 aa  43.9  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00134797  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5526  putative stress-response protein  47.83 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.289766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  46.15 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236327 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1847  CsbD family protein  47.73 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.373794  normal  0.439054 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03877  hypothetical protein  47.83 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4552  putative stress-response protein  47.83 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4507  putative stress-response protein  46.94 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4285  putative stress-response protein  47.83 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5280  CsbD-like  42.59 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0833  hypothetical protein  47.06 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000181755  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5578  CsbD family protein  42.59 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.675487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4598  putative stress-response protein  47.83 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3473  CsbD family protein  43.14 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3983  putative stress-response protein  47.83 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.216116 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03917  predicted stress response protein  47.83 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3948  CsbD family protein  47.83 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  46.15 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0515  putative stress-response protein  41.18 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  46.15 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4634  putative stress-response protein  45.65 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.27716 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4497  putative stress-response protein  45.65 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4432  putative stress-response protein  45.65 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000026393 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4582  putative stress-response protein  45.65 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4583  putative stress-response protein  45.65 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.808019 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1345  CsbD family protein  46.15 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3610  CsbD family protein  47.92 
 
 		 66 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0252527  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3336  hypothetical protein  44 
 
 		 70 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3505  CsbD-like  41.3 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00399435  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  43.75 
 
 		 61 aa  41.2  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  44.23 
 
 		 57 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5651  CsbD family protein  36.54 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4351  CsbD-like  42.59 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0852  CsbD family protein  45.65 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3861  CsbD family protein  41.82 
 
 		 59 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2156  CsbD family protein  43.86 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.703881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2617  CsbD family protein  43.18 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3988  CsbD-like  44.44 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0055  CsbD family protein  38 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587208 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  44.9 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0951  CsbD family protein  40.38 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0941  CsbD family protein  47.73 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455689 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1179  hypothetical protein  52.5 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.392702  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  40.38 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03817  protein YjbJ  44.44 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1731  CsbD-like  42.86 
 
 		 65 aa  40  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.888491  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2679  hypothetical protein  43.75 
 
 		 63 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4727  CsbD family protein  38.64 
 
 		 69 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781625  hitchhiker  0.00687348 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1706  CsbD family protein  40.82 
 
 		 58 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0926175  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>