67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7180 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7180  CsbD family protein  100 
 
 		 98 aa  182  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2617  CsbD family protein  63.27 
 
 		 98 aa  98.6  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2686  CsbD family protein  55.1 
 
 		 98 aa  89  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0451307  normal  0.845965 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5162  CsbD family protein  60.34 
 
 		 61 aa  67  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  56.06 
 
 		 67 aa  65.5  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4149  hypothetical protein  36.73 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0600669  normal  0.0864277 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37400  CsbD-like protein  54.39 
 
 		 57 aa  60.1  0.000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0215657  normal  0.523967 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3862  CsbD family protein  36.08 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4568  CsbD family protein  48.28 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3472  CsbD family protein  50 
 
 		 58 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4993  CsbD family protein  47.37 
 
 		 57 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0195  CsbD family protein  45.61 
 
 		 57 aa  51.6  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3263  CsbD family protein  45.07 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3380  CsbD family protein  48.21 
 
 		 64 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.579569 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0295  CsbD family protein  58.14 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  44.62 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3066  CsbD family protein  48.21 
 
 		 58 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4678  CsbD-like  48.21 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3456  CsbD family protein  46.43 
 
 		 56 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0288514 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1078  CsbD family protein  48.21 
 
 		 56 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5110  CsbD family protein  42.86 
 
 		 57 aa  47.4  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2222  CsbD family protein  47.06 
 
 		 63 aa  47.4  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0127575 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2405  CsbD family protein  47.83 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.448422  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4070  CsbD family protein  48.44 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  42.19 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236327 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0307  CsbD family protein  43.1 
 
 		 60 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2052  CsbD family protein  45.61 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3271  CsbD family protein  44.64 
 
 		 58 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4913  CsbD family protein  43.4 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.39688  normal  0.521476 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0951  CsbD family protein  44.23 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3578  CsbD family protein  46.43 
 
 		 57 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1219  CsbD-like  43.4 
 
 		 72 aa  44.3  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3574  CsbD family protein  46.43 
 
 		 58 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3392  hypothetical protein  42.19 
 
 		 138 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0935908  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3271  CsbD family protein  42.86 
 
 		 62 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.308977 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  39.06 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  38.46 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  38.46 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5089  CsbD family protein  44.64 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.634424 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4790  CsbD family protein  44.64 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4704  CsbD-like protein  44.64 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2010  CsbD-like  39.29 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000265907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3234  CsbD family protein  37.5 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.281578  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11610  CsbD-like protein  38.6 
 
 		 58 aa  42  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.583154 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0941  CsbD family protein  47.06 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455689 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2861  CsbD family protein  45.83 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304574  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2380  CsbD family protein  43.55 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.30927  hitchhiker  0.000131462 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  50 
 
 		 55 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  44.83 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0394  hypothetical protein  42.86 
 
 		 51 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  40.38 
 
 		 57 aa  41.6  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1403  hypothetical protein  38.6 
 
 		 60 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.436132 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  40.38 
 
 		 74 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1217  CsbD family protein  40.35 
 
 		 73 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4561  CsbD family protein  44.23 
 
 		 59 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5653  CsbD family protein  40.62 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4456  CsbD family protein  40.62 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.966914 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5261  hypothetical protein  41.07 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.197207 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  42.86 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5236  CsbD family protein  54.35 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00387932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  37.5 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1353  CsbD family protein  43.75 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43261e-22 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4239  CsbD family protein  44.64 
 
 		 57 aa  40.4  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.541601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  35.38 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3782  CsbD-like  41.82 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.45663  normal  0.0243288 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3194  CsbD family protein  38.46 
 
 		 101 aa  40.4  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.828188  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4351  CsbD-like  43.64 
 
 		 63 aa  40  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>