44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0295 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0295  CsbD family protein  100 
 
 		 69 aa  128  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4070  CsbD family protein  72.46 
 
 		 69 aa  94.4  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0312  CsbD family protein  65.22 
 
 		 69 aa  70.1  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3345  CsbD family protein  53.62 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.97311  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5110  CsbD family protein  46.43 
 
 		 57 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4704  CsbD-like protein  50 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5089  CsbD family protein  50 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.634424 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4790  CsbD family protein  50 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3380  CsbD family protein  42.42 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.579569 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4678  CsbD-like  43.33 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4568  CsbD family protein  43.28 
 
 		 64 aa  47.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4993  CsbD family protein  43.86 
 
 		 57 aa  47.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4239  CsbD family protein  48.21 
 
 		 57 aa  47.4  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.541601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0307  CsbD family protein  45.61 
 
 		 60 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  41.54 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2052  CsbD family protein  43.33 
 
 		 61 aa  46.2  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1078  CsbD family protein  48.15 
 
 		 56 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37400  CsbD-like protein  46.43 
 
 		 57 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0215657  normal  0.523967 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  36.92 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3066  CsbD family protein  48.21 
 
 		 58 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  36.92 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0195  CsbD family protein  42.86 
 
 		 57 aa  44.3  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3392  hypothetical protein  39.39 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0935908  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1217  CsbD family protein  42.11 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3271  CsbD family protein  46.97 
 
 		 58 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  37.74 
 
 		 57 aa  43.5  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3578  CsbD family protein  46.43 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  37.88 
 
 		 67 aa  42.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  37.74 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3271  CsbD family protein  36.67 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.308977 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  37.74 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5162  CsbD family protein  41.07 
 
 		 61 aa  42  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7180  CsbD family protein  57.14 
 
 		 98 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0941  CsbD family protein  49.06 
 
 		 64 aa  41.6  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455689 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0649  hypothetical protein  41.18 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0408075  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3456  CsbD family protein  39.29 
 
 		 56 aa  41.2  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0288514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4149  hypothetical protein  36.92 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0600669  normal  0.0864277 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3574  CsbD family protein  42.86 
 
 		 58 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  33.85 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  39.66 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3681  CsbD family protein  35.71 
 
 		 76 aa  40.8  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340646  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4486  CsbD family protein  41.67 
 
 		 60 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5261  hypothetical protein  40 
 
 		 60 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.197207 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11610  CsbD-like protein  42.86 
 
 		 58 aa  40  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.583154 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>