33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4070 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4070  CsbD family protein  100 
 
 		 69 aa  125  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0295  CsbD family protein  72.46 
 
 		 69 aa  94.4  5e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0312  CsbD family protein  71.01 
 
 		 69 aa  71.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3345  CsbD family protein  55.07 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.97311  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  48.48 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5110  CsbD family protein  54.72 
 
 		 57 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0307  CsbD family protein  49.25 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2052  CsbD family protein  51.67 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4568  CsbD family protein  49.25 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4239  CsbD family protein  51.79 
 
 		 57 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.541601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3271  CsbD family protein  60 
 
 		 58 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3066  CsbD family protein  62 
 
 		 58 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3380  CsbD family protein  45.45 
 
 		 64 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.579569 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3578  CsbD family protein  55.36 
 
 		 57 aa  47  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1078  CsbD family protein  50 
 
 		 56 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37400  CsbD-like protein  53.33 
 
 		 57 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0215657  normal  0.523967 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3804  CsbD-like  40.68 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.41973  normal  0.44749 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3574  CsbD family protein  50.88 
 
 		 58 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2351  hypothetical protein  45.21 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0996638  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4678  CsbD-like  43.33 
 
 		 60 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4993  CsbD family protein  43.75 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3456  CsbD family protein  53.33 
 
 		 56 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0288514 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0195  CsbD family protein  51.11 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5089  CsbD family protein  47.46 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.634424 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4790  CsbD family protein  47.46 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4704  CsbD-like protein  47.46 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3758  CsbD family protein  37.1 
 
 		 64 aa  42  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.398695  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05760  CsbD-like protein  50 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.309662  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1217  CsbD family protein  45.31 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0200  CsbD family protein  35.56 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0220  hypothetical protein  35.56 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2222  CsbD family protein  49.06 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0127575 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2564  hypothetical protein  54.76 
 
 		 78 aa  40  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.100203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>