35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0312 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0312  CsbD family protein  100 
 
 		 69 aa  127  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4070  CsbD family protein  71.01 
 
 		 69 aa  85.5  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0295  CsbD family protein  65.22 
 
 		 69 aa  80.5  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3345  CsbD family protein  50.72 
 
 		 65 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.97311  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2052  CsbD family protein  50 
 
 		 61 aa  50.4  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4568  CsbD family protein  50.75 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1078  CsbD family protein  54.39 
 
 		 56 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3758  CsbD family protein  39.39 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.398695  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37400  CsbD-like protein  47.54 
 
 		 57 aa  45.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0215657  normal  0.523967 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0841  CsbD family protein  46.3 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00257434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0857  CsbD family protein  46.3 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00154201  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5110  CsbD family protein  47.37 
 
 		 57 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4913  CsbD family protein  47.46 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.39688  normal  0.521476 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2561  CsbD family protein  45.61 
 
 		 56 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3472  CsbD family protein  45.9 
 
 		 58 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0307  CsbD family protein  46.88 
 
 		 60 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  40.91 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4704  CsbD-like protein  49.12 
 
 		 57 aa  42.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5089  CsbD family protein  49.12 
 
 		 57 aa  42.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.634424 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4790  CsbD family protein  49.12 
 
 		 57 aa  42.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3804  CsbD-like  42.86 
 
 		 60 aa  42.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.41973  normal  0.44749 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3574  CsbD family protein  49.12 
 
 		 58 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0195  CsbD family protein  45.9 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  40 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1217  CsbD family protein  45.61 
 
 		 73 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1063  hypothetical protein  38.33 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4306299999999999e-37 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0923  hypothetical protein  38.33 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0891  hypothetical protein  38.33 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0987  hypothetical protein  38.33 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1081  hypothetical protein  36.67 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0908  hypothetical protein  38.33 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000630947  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4275  hypothetical protein  36.67 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.186027  hitchhiker  0.00765973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0974  CsbD family protein  50 
 
 		 59 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000000559143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4239  CsbD family protein  45.61 
 
 		 57 aa  40.4  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.541601  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0494  hypothetical protein  41.27 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.109634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>