43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3472 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3472  CsbD family protein  100 
 
 		 58 aa  110  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37400  CsbD-like protein  64.91 
 
 		 57 aa  68.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0215657  normal  0.523967 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0195  CsbD family protein  56.14 
 
 		 57 aa  61.2  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  54.39 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3066  CsbD family protein  58.18 
 
 		 58 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3574  CsbD family protein  58.18 
 
 		 58 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3456  CsbD family protein  51.79 
 
 		 56 aa  55.5  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0288514 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3263  CsbD family protein  54.39 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3271  CsbD family protein  54.55 
 
 		 58 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5162  CsbD family protein  49.12 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11610  CsbD-like protein  50 
 
 		 58 aa  53.9  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.583154 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4993  CsbD family protein  47.27 
 
 		 57 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3578  CsbD family protein  52.63 
 
 		 57 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2052  CsbD family protein  47.37 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05760  CsbD-like protein  45.45 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.309662  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4568  CsbD family protein  47.37 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4239  CsbD family protein  49.09 
 
 		 57 aa  47  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.541601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2222  CsbD family protein  52 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0127575 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3758  CsbD family protein  42.11 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.398695  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2156  CsbD family protein  40.38 
 
 		 59 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.703881 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4678  CsbD-like  44.83 
 
 		 60 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3345  CsbD family protein  52.83 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.97311  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1078  CsbD family protein  45.1 
 
 		 56 aa  44.7  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3666  hypothetical protein  42.86 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0579437  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0307  CsbD family protein  47.27 
 
 		 60 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3320  CsbD family protein  42.86 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525397  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3380  CsbD family protein  43.64 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.579569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4149  hypothetical protein  44.9 
 
 		 98 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0600669  normal  0.0864277 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3743  hypothetical protein  41.07 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3644  hypothetical protein  41.07 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1574  hypothetical protein  41.07 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222818  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3681  CsbD family protein  40 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340646  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3694  hypothetical protein  41.07 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367193  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3424  hypothetical protein  41.07 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.963083  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3655  hypothetical protein  41.07 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4913  CsbD family protein  40 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.39688  normal  0.521476 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4351  CsbD-like  41.18 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1217  CsbD family protein  45.45 
 
 		 73 aa  41.6  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3385  hypothetical protein  39.29 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00837674  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1596  hypothetical protein  41.18 
 
 		 63 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.446772  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1630  CsbD family protein  44.68 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0951  CsbD family protein  35.19 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5110  CsbD family protein  37.5 
 
 		 57 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>