35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4239 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4239  CsbD family protein  100 
 
 		 57 aa  106  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.541601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3578  CsbD family protein  67.86 
 
 		 57 aa  67  0.00000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3574  CsbD family protein  66.07 
 
 		 58 aa  65.9  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4993  CsbD family protein  56.14 
 
 		 57 aa  62  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3456  CsbD family protein  60.71 
 
 		 56 aa  61.6  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0288514 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1078  CsbD family protein  53.57 
 
 		 56 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3066  CsbD family protein  60.71 
 
 		 58 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37400  CsbD-like protein  55.36 
 
 		 57 aa  58.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0215657  normal  0.523967 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4704  CsbD-like protein  55.36 
 
 		 57 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5089  CsbD family protein  55.36 
 
 		 57 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.634424 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4790  CsbD family protein  55.36 
 
 		 57 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3271  CsbD family protein  57.14 
 
 		 58 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11610  CsbD-like protein  55.36 
 
 		 58 aa  55.1  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.583154 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5162  CsbD family protein  51.79 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0307  CsbD family protein  55.36 
 
 		 60 aa  53.5  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3380  CsbD family protein  50.79 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.579569 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0195  CsbD family protein  48.21 
 
 		 57 aa  52  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  51.79 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3345  CsbD family protein  53.7 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.97311  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4070  CsbD family protein  51.79 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2561  CsbD family protein  46.43 
 
 		 56 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3263  CsbD family protein  53.7 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3758  CsbD family protein  46.43 
 
 		 64 aa  48.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.398695  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0295  CsbD family protein  48.21 
 
 		 69 aa  47.4  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1217  CsbD family protein  46.43 
 
 		 73 aa  47  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3472  CsbD family protein  49.09 
 
 		 58 aa  47  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3804  CsbD-like  42.86 
 
 		 60 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.41973  normal  0.44749 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3681  CsbD family protein  48.21 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340646  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4568  CsbD family protein  46.43 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  49.06 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5110  CsbD family protein  44.64 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  47.17 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0200  CsbD family protein  37.5 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0220  hypothetical protein  37.5 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4913  CsbD family protein  41.82 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.39688  normal  0.521476 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>