27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0200 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_0220  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0200  CsbD family protein  100 
 
 
64 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3578  CsbD family protein  45.61 
 
 
57 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3574  CsbD family protein  48.21 
 
 
58 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37400  CsbD-like protein  41.07 
 
 
57 aa  53.5  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0215657  normal  0.523967 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2561  CsbD family protein  41.07 
 
 
56 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3804  CsbD-like  46.43 
 
 
60 aa  52  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.41973  normal  0.44749 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4993  CsbD family protein  38.6 
 
 
57 aa  50.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3456  CsbD family protein  44.64 
 
 
56 aa  48.9  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0288514 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0195  CsbD family protein  38.6 
 
 
57 aa  48.5  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6483  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4568  CsbD family protein  37.29 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4704  CsbD-like protein  42.31 
 
 
57 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5089  CsbD family protein  42.31 
 
 
57 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.634424 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4790  CsbD family protein  42.31 
 
 
57 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354066  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0307  CsbD family protein  42.11 
 
 
60 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11610  CsbD-like protein  36.21 
 
 
58 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.583154 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3271  CsbD family protein  35.71 
 
 
58 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4913  CsbD family protein  34.43 
 
 
63 aa  45.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.39688  normal  0.521476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1217  CsbD family protein  38.6 
 
 
73 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5110  CsbD family protein  41.07 
 
 
57 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3758  CsbD family protein  41.27 
 
 
64 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.398695  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1078  CsbD family protein  36.54 
 
 
56 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3681  CsbD family protein  41.07 
 
 
76 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340646  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3380  CsbD family protein  35.94 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.579569 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4239  CsbD family protein  37.5 
 
 
57 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.541601  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4070  CsbD family protein  35.56 
 
 
69 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3066  CsbD family protein  33.93 
 
 
58 aa  40.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>