50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4568 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4568  CsbD family protein  100 
 
 		 64 aa  120  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5162  CsbD family protein  63.79 
 
 		 61 aa  70.5  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0307  CsbD family protein  60.34 
 
 		 60 aa  65.9  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1078  CsbD family protein  65.38 
 
 		 56 aa  62  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4993  CsbD family protein  56.14 
 
 		 57 aa  62.8  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3380  CsbD family protein  54.84 
 
 		 64 aa  62  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.579569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37400  CsbD-like protein  56.14 
 
 		 57 aa  61.2  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0215657  normal  0.523967 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3456  CsbD family protein  55.36 
 
 		 56 aa  60.5  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0288514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3758  CsbD family protein  51.61 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.398695  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  51.67 
 
 		 67 aa  57  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4704  CsbD-like protein  55.36 
 
 		 57 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4790  CsbD family protein  55.36 
 
 		 57 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1217  CsbD family protein  50.88 
 
 		 73 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5089  CsbD family protein  55.36 
 
 		 57 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.634424 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3345  CsbD family protein  50.79 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.97311  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2052  CsbD family protein  51.67 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0195  CsbD family protein  50.88 
 
 		 57 aa  53.9  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3578  CsbD family protein  52.63 
 
 		 57 aa  52  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2561  CsbD family protein  50 
 
 		 56 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3574  CsbD family protein  53.57 
 
 		 58 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3263  CsbD family protein  46.77 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5110  CsbD family protein  50 
 
 		 57 aa  49.7  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4070  CsbD family protein  49.25 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0494  hypothetical protein  48.21 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.109634  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3066  CsbD family protein  48.21 
 
 		 58 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0200  CsbD family protein  37.29 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3472  CsbD family protein  47.37 
 
 		 58 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0220  hypothetical protein  37.29 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3468  CsbD family protein  47.73 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517698  normal  0.22069 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0295  CsbD family protein  43.28 
 
 		 69 aa  47.4  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3804  CsbD-like  41.07 
 
 		 60 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.41973  normal  0.44749 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3271  CsbD family protein  48.21 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2222  CsbD family protein  49.02 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0127575 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4913  CsbD family protein  46.3 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.39688  normal  0.521476 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0833  hypothetical protein  43.1 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000181755  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11610  CsbD-like protein  43.86 
 
 		 58 aa  44.3  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.583154 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4239  CsbD family protein  46.43 
 
 		 57 aa  43.9  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.541601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  43.1 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  46.15 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  44.23 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0857  CsbD family protein  47.06 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00154201  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0841  CsbD family protein  47.06 
 
 		 64 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00257434  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  44.23 
 
 		 74 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  54.76 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  52.27 
 
 		 55 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4678  CsbD-like  46.43 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  41.07 
 
 		 61 aa  40.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0649  hypothetical protein  40.28 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0408075  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7180  CsbD family protein  50 
 
 		 98 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141248  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1136  hypothetical protein  39.62 
 
 		 65 aa  40  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00391813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>