56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3066 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3066  CsbD family protein  100 
 
 
58 aa  111  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3271  CsbD family protein  84.48 
 
 
58 aa  95.9  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3574  CsbD family protein  68.97 
 
 
58 aa  77.4  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0195  CsbD family protein  66.07 
 
 
57 aa  74.3  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6483  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37400  CsbD-like protein  67.86 
 
 
57 aa  72  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0215657  normal  0.523967 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3578  CsbD family protein  71.43 
 
 
57 aa  71.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3681  CsbD family protein  53.45 
 
 
76 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340646  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  60.71 
 
 
67 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11610  CsbD-like protein  58.93 
 
 
58 aa  64.3  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.583154 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3345  CsbD family protein  64.15 
 
 
65 aa  60.8  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.97311  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3456  CsbD family protein  55.36 
 
 
56 aa  60.5  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0288514 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4239  CsbD family protein  60.71 
 
 
57 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.541601  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3472  CsbD family protein  58.18 
 
 
58 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3380  CsbD family protein  52.63 
 
 
64 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.579569 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0307  CsbD family protein  53.57 
 
 
60 aa  54.7  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3263  CsbD family protein  54.72 
 
 
76 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4993  CsbD family protein  50 
 
 
57 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2222  CsbD family protein  51.85 
 
 
63 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0127575 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2561  CsbD family protein  48.21 
 
 
56 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5162  CsbD family protein  49.06 
 
 
61 aa  51.2  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4704  CsbD-like protein  52.83 
 
 
57 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5089  CsbD family protein  52.83 
 
 
57 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.634424 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4790  CsbD family protein  52.83 
 
 
57 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354066  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1078  CsbD family protein  50 
 
 
56 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5110  CsbD family protein  45.61 
 
 
57 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4568  CsbD family protein  48.21 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4070  CsbD family protein  62 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1217  CsbD family protein  48.21 
 
 
73 aa  47  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2052  CsbD family protein  49.06 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  46.15 
 
 
57 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4913  CsbD family protein  43.1 
 
 
63 aa  45.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.39688  normal  0.521476 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  44.23 
 
 
57 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  42.31 
 
 
57 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0295  CsbD family protein  48.21 
 
 
69 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3666  hypothetical protein  43.33 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0579437  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3743  hypothetical protein  41.67 
 
 
70 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3320  CsbD family protein  41.67 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525397  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3655  hypothetical protein  41.67 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3424  hypothetical protein  41.67 
 
 
70 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.963083  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3694  hypothetical protein  41.67 
 
 
70 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367193  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3804  CsbD-like  39.29 
 
 
60 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.41973  normal  0.44749 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1574  hypothetical protein  41.67 
 
 
70 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222818  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3644  hypothetical protein  41.67 
 
 
70 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4068  CsbD family protein  41.07 
 
 
59 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1328  CsbD family protein  42.86 
 
 
59 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3271  CsbD family protein  40.35 
 
 
62 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.308977 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3385  hypothetical protein  40 
 
 
70 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00837674  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  38.46 
 
 
57 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3861  CsbD family protein  37.5 
 
 
59 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4561  CsbD family protein  41.07 
 
 
59 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135073  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4486  CsbD family protein  42.11 
 
 
60 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4678  CsbD-like  42.11 
 
 
60 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5653  CsbD family protein  48.98 
 
 
67 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52436  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4456  CsbD family protein  48.98 
 
 
67 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.966914 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0200  CsbD family protein  33.93 
 
 
64 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0220  hypothetical protein  33.93 
 
 
64 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>