42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0307 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0307  CsbD family protein  100 
 
 		 60 aa  110  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3380  CsbD family protein  63.79 
 
 		 64 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.579569 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3456  CsbD family protein  60.71 
 
 		 56 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0288514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1217  CsbD family protein  68.42 
 
 		 73 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4568  CsbD family protein  60.34 
 
 		 64 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3345  CsbD family protein  64.81 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.97311  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1078  CsbD family protein  61.54 
 
 		 56 aa  63.5  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4993  CsbD family protein  54.39 
 
 		 57 aa  61.6  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3574  CsbD family protein  64.29 
 
 		 58 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3263  CsbD family protein  53.45 
 
 		 76 aa  60.8  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3758  CsbD family protein  51.72 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.398695  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3804  CsbD-like  50.88 
 
 		 60 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.41973  normal  0.44749 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3578  CsbD family protein  62.5 
 
 		 57 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37400  CsbD-like protein  54.39 
 
 		 57 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0215657  normal  0.523967 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0195  CsbD family protein  54.39 
 
 		 57 aa  59.3  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2052  CsbD family protein  50 
 
 		 61 aa  58.5  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5110  CsbD family protein  48.21 
 
 		 57 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4790  CsbD family protein  57.14 
 
 		 57 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5089  CsbD family protein  57.14 
 
 		 57 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.634424 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4704  CsbD-like protein  57.14 
 
 		 57 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2561  CsbD family protein  51.79 
 
 		 56 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3066  CsbD family protein  53.57 
 
 		 58 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5162  CsbD family protein  49.15 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3681  CsbD family protein  49.12 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340646  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  51.67 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4239  CsbD family protein  55.36 
 
 		 57 aa  53.5  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.541601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11610  CsbD-like protein  52.63 
 
 		 58 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.583154 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3271  CsbD family protein  51.79 
 
 		 58 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4070  CsbD family protein  49.25 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0295  CsbD family protein  45.61 
 
 		 69 aa  47  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0200  CsbD family protein  42.11 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0220  hypothetical protein  42.11 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  43.1 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  50 
 
 		 57 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4913  CsbD family protein  45.45 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.39688  normal  0.521476 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3472  CsbD family protein  47.27 
 
 		 58 aa  44.3  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2222  CsbD family protein  40 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0127575 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  46.15 
 
 		 57 aa  42.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3392  hypothetical protein  48 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0935908  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  44.23 
 
 		 57 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4678  CsbD-like  40 
 
 		 60 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05760  CsbD-like protein  40 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.309662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>