50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_11610 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_11610  CsbD-like protein  100 
 
 		 58 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.583154 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0195  CsbD family protein  63.16 
 
 		 57 aa  73.2  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3066  CsbD family protein  58.93 
 
 		 58 aa  64.3  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3681  CsbD family protein  50 
 
 		 76 aa  64.3  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340646  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37400  CsbD-like protein  57.89 
 
 		 57 aa  63.9  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0215657  normal  0.523967 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3578  CsbD family protein  57.89 
 
 		 57 aa  63.9  0.0000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3271  CsbD family protein  60.71 
 
 		 58 aa  63.9  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3574  CsbD family protein  58.93 
 
 		 58 aa  63.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3456  CsbD family protein  53.57 
 
 		 56 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0288514 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4239  CsbD family protein  55.36 
 
 		 57 aa  55.1  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.541601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  49.12 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3472  CsbD family protein  50 
 
 		 58 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4993  CsbD family protein  47.37 
 
 		 57 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5110  CsbD family protein  50 
 
 		 57 aa  53.9  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3263  CsbD family protein  52.63 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3804  CsbD-like  46.43 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.41973  normal  0.44749 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0307  CsbD family protein  52.63 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4913  CsbD family protein  49.09 
 
 		 63 aa  50.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.39688  normal  0.521476 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5162  CsbD family protein  43.86 
 
 		 61 aa  50.4  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1078  CsbD family protein  48.08 
 
 		 56 aa  50.1  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3380  CsbD family protein  47.62 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.579569 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2052  CsbD family protein  43.86 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2561  CsbD family protein  39.29 
 
 		 56 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  47.27 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3345  CsbD family protein  51.85 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.97311  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3758  CsbD family protein  42.11 
 
 		 64 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.398695  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3385  hypothetical protein  42.86 
 
 		 70 aa  45.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00837674  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0200  CsbD family protein  36.21 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0220  hypothetical protein  36.21 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5089  CsbD family protein  46.43 
 
 		 57 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.634424 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4704  CsbD-like protein  46.43 
 
 		 57 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4790  CsbD family protein  46.43 
 
 		 57 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4568  CsbD family protein  43.86 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3320  CsbD family protein  41.07 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3424  hypothetical protein  41.07 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.963083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3644  hypothetical protein  41.07 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1574  hypothetical protein  41.07 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222818  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3743  hypothetical protein  41.07 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3694  hypothetical protein  41.07 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3655  hypothetical protein  41.07 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3666  hypothetical protein  45.1 
 
 		 67 aa  42  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0579437  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1217  CsbD family protein  43.86 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0833  hypothetical protein  40.35 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000181755  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2222  CsbD family protein  42.31 
 
 		 63 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0127575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4678  CsbD-like  36.21 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2380  CsbD family protein  46.94 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.30927  hitchhiker  0.000131462 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2010  CsbD-like  35.71 
 
 		 60 aa  40.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000265907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0941  CsbD family protein  45.28 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455689 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4486  CsbD family protein  35.71 
 
 		 60 aa  40  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0295  CsbD family protein  42.86 
 
 		 69 aa  40  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>