76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3231 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  100 
 
 		 67 aa  124  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37400  CsbD-like protein  61.4 
 
 		 57 aa  68.2  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0215657  normal  0.523967 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3066  CsbD family protein  60.71 
 
 		 58 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  53.23 
 
 		 67 aa  62  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5162  CsbD family protein  54.39 
 
 		 61 aa  61.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  50 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3472  CsbD family protein  54.39 
 
 		 58 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  50 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0195  CsbD family protein  52.63 
 
 		 57 aa  59.3  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  50 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4568  CsbD family protein  51.67 
 
 		 64 aa  57  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3271  CsbD family protein  53.57 
 
 		 58 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4351  CsbD-like  51.72 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2052  CsbD family protein  52.46 
 
 		 61 aa  56.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11610  CsbD-like protein  49.12 
 
 		 58 aa  54.7  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.583154 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3574  CsbD family protein  55.36 
 
 		 58 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3263  CsbD family protein  49.21 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  52.63 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236327 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0307  CsbD family protein  51.67 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3456  CsbD family protein  51.79 
 
 		 56 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0288514 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4070  CsbD family protein  48.48 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  52.63 
 
 		 71 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1596  hypothetical protein  48.28 
 
 		 63 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.446772  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  45.9 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3380  CsbD family protein  46.88 
 
 		 64 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.579569 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4239  CsbD family protein  51.79 
 
 		 57 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.541601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  45.9 
 
 		 67 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3782  CsbD-like  46.55 
 
 		 63 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.45663  normal  0.0243288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4077  CsbD-like  48.28 
 
 		 71 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05760  CsbD-like protein  45 
 
 		 69 aa  50.1  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.309662  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3578  CsbD family protein  50.88 
 
 		 57 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7180  CsbD family protein  56.06 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.141248  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4561  CsbD family protein  50.91 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4905  CsbD family protein  47.37 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.5432  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4068  CsbD family protein  49.09 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3861  CsbD family protein  45.45 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  44.83 
 
 		 71 aa  48.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1328  CsbD family protein  49.09 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  52.63 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3345  CsbD family protein  46.97 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.97311  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5653  CsbD family protein  45.9 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4456  CsbD family protein  45.9 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.966914 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02330  CsbD-like stress response protein  44.83 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0752085  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5381  CsbD family protein  41.94 
 
 		 67 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2201  hypothetical protein  44.83 
 
 		 71 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2686  CsbD family protein  46.27 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0451307  normal  0.845965 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2222  CsbD family protein  45.61 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0127575 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0071  CsbD family protein  45.61 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.839575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4993  CsbD family protein  43.86 
 
 		 57 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1078  CsbD family protein  50 
 
 		 56 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3862  CsbD family protein  43.75 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1219  CsbD-like  48.15 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  42.62 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5110  CsbD family protein  44.64 
 
 		 57 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1434  CsbD-like protein  58.54 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0951  CsbD family protein  44.23 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0606  hypothetical protein  40.32 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.306362  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4678  CsbD-like  45 
 
 		 60 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0616  CsbD family protein  43.86 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.396611  normal  0.591688 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0295  CsbD family protein  37.88 
 
 		 69 aa  42.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  40.38 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3681  CsbD family protein  41.07 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340646  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  42.31 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4913  CsbD family protein  40 
 
 		 63 aa  42  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.39688  normal  0.521476 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1221  hypothetical protein  43.75 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000483184  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1963  hypothetical protein  45.28 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.435104  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2561  CsbD family protein  42.86 
 
 		 56 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1079  CsbD-like  47.62 
 
 		 71 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0315456  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  40.38 
 
 		 57 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0658  CsbD family protein  42.11 
 
 		 63 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1345  CsbD family protein  38.6 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  38.46 
 
 		 57 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2156  CsbD family protein  43.14 
 
 		 59 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.703881 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3468  CsbD family protein  43.18 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517698  normal  0.22069 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3473  CsbD family protein  44.44 
 
 		 59 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3279  CsbD family protein  40.35 
 
 		 61 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>