21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1963 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1963  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  120  7e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.435104  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1317  hypothetical protein  56.25 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.121882  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0619  hypothetical protein  52.46 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05760  CsbD-like protein  46.38 
 
 		 69 aa  52.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.309662  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0606  hypothetical protein  49.18 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.306362  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2052  CsbD family protein  51.85 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1716  CsbD family protein  47.46 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000823848  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1683  CsbD family protein  47.46 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000685848  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2679  hypothetical protein  52 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3473  CsbD family protein  50 
 
 		 63 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4048  CsbD family protein  50 
 
 		 63 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5248  CsbD family protein  48 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489032  normal  0.455845 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3415  CsbD family protein  48 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1221  hypothetical protein  48.44 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000483184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0841  CsbD family protein  45.76 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00257434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0857  CsbD family protein  45.76 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00154201  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2752  protein of unknown function DUF883, ElaB  41.51 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000718786  hitchhiker  0.0000953283 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  45.28 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5153  CsbD family protein  42 
 
 		 63 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.587859 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1136  hypothetical protein  44.44 
 
 		 65 aa  40.4  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00391813  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3263  CsbD family protein  41.07 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>