62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2052 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2052  CsbD family protein  100 
 
 		 61 aa  113  7.999999999999999e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2222  CsbD family protein  64.29 
 
 		 63 aa  67  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0127575 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0195  CsbD family protein  57.89 
 
 		 57 aa  63.9  0.0000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3456  CsbD family protein  58.93 
 
 		 56 aa  60.5  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0288514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5162  CsbD family protein  55.93 
 
 		 61 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0307  CsbD family protein  50 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  52.46 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37400  CsbD-like protein  50.88 
 
 		 57 aa  55.1  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0215657  normal  0.523967 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5110  CsbD family protein  51.79 
 
 		 57 aa  55.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3380  CsbD family protein  50 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.579569 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4568  CsbD family protein  51.67 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2561  CsbD family protein  48.21 
 
 		 56 aa  53.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4913  CsbD family protein  52.73 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.39688  normal  0.521476 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  49.15 
 
 		 62 aa  50.8  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1963  hypothetical protein  51.85 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.435104  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3472  CsbD family protein  47.37 
 
 		 58 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4070  CsbD family protein  51.67 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1078  CsbD family protein  48.08 
 
 		 56 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0619  hypothetical protein  57.41 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3345  CsbD family protein  51.85 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.97311  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11610  CsbD-like protein  43.86 
 
 		 58 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.583154 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2679  hypothetical protein  50 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1217  CsbD family protein  49.15 
 
 		 73 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02330  CsbD-like stress response protein  43.86 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0752085  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3574  CsbD family protein  48.21 
 
 		 58 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4678  CsbD-like  43.33 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3066  CsbD family protein  49.06 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3758  CsbD family protein  39.66 
 
 		 64 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.398695  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4048  CsbD family protein  47.17 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0295  CsbD family protein  43.33 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3473  CsbD family protein  45.28 
 
 		 63 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3415  CsbD family protein  48.08 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0606  hypothetical protein  53.7 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.306362  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5153  CsbD family protein  38.6 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.587859 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0312  CsbD family protein  52.94 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5248  CsbD family protein  48.08 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489032  normal  0.455845 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3263  CsbD family protein  45.61 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3271  CsbD family protein  47.17 
 
 		 58 aa  45.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4704  CsbD-like protein  47.54 
 
 		 57 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5089  CsbD family protein  47.54 
 
 		 57 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.634424 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4790  CsbD family protein  47.54 
 
 		 57 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3578  CsbD family protein  45.61 
 
 		 57 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3804  CsbD-like  37.5 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.41973  normal  0.44749 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05760  CsbD-like protein  41.67 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.309662  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1683  CsbD family protein  40.38 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000685848  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1716  CsbD family protein  40.38 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000823848  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4486  CsbD family protein  36.67 
 
 		 60 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4993  CsbD family protein  38.6 
 
 		 57 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1219  CsbD-like  43.64 
 
 		 72 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1550  CsbD family protein  41.51 
 
 		 62 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0886434  normal  0.217022 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1221  hypothetical protein  42.62 
 
 		 67 aa  42  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000483184  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1879  CsbD family protein  41.51 
 
 		 62 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1786  CsbD family protein  42.31 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30394  normal  0.432294 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0616  CsbD family protein  39.66 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.396611  normal  0.591688 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2423  CsbD family protein  46 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4184  CsbD family protein  42.11 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.432909 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3234  CsbD family protein  36.67 
 
 		 60 aa  40.8  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.281578  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1940  CsbD family protein  45.28 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1855  CsbD family protein  45.28 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.268562  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1145  CsbD family protein  42.11 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1578  CsbD family protein  43.14 
 
 		 82 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0515828  normal  0.510488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6962  hypothetical protein  39.29 
 
 		 122 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>