66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4993 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4993  CsbD family protein  100 
 
 		 57 aa  110  9e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1078  CsbD family protein  57.14 
 
 		 56 aa  69.7  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3456  CsbD family protein  58.93 
 
 		 56 aa  66.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0288514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3380  CsbD family protein  57.81 
 
 		 64 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.579569 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5162  CsbD family protein  57.89 
 
 		 61 aa  64.3  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4239  CsbD family protein  56.14 
 
 		 57 aa  62  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.541601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4568  CsbD family protein  56.14 
 
 		 64 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0307  CsbD family protein  54.39 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37400  CsbD-like protein  54.39 
 
 		 57 aa  60.8  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0215657  normal  0.523967 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3804  CsbD-like  50 
 
 		 60 aa  60.5  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.41973  normal  0.44749 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4704  CsbD-like protein  50 
 
 		 57 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2561  CsbD family protein  51.79 
 
 		 56 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4790  CsbD family protein  50 
 
 		 57 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3758  CsbD family protein  50.88 
 
 		 64 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.398695  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5089  CsbD family protein  50 
 
 		 57 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.634424 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0195  CsbD family protein  52.63 
 
 		 57 aa  59.3  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1217  CsbD family protein  47.37 
 
 		 73 aa  57  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3578  CsbD family protein  51.79 
 
 		 57 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3574  CsbD family protein  53.57 
 
 		 58 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3472  CsbD family protein  47.27 
 
 		 58 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11610  CsbD-like protein  47.37 
 
 		 58 aa  53.9  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.583154 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3066  CsbD family protein  50 
 
 		 58 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5110  CsbD family protein  48.21 
 
 		 57 aa  52.4  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3263  CsbD family protein  50.88 
 
 		 76 aa  52  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0200  CsbD family protein  38.6 
 
 		 64 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0220  hypothetical protein  38.6 
 
 		 64 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3681  CsbD family protein  40.35 
 
 		 76 aa  50.1  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340646  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  46.43 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3271  CsbD family protein  46.43 
 
 		 58 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0295  CsbD family protein  43.86 
 
 		 69 aa  47.4  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2222  CsbD family protein  48.98 
 
 		 63 aa  47  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0127575 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4913  CsbD family protein  41.82 
 
 		 63 aa  47  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.39688  normal  0.521476 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  46.15 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  46.15 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  43.86 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3392  hypothetical protein  44.83 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0935908  normal  0.942067 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1384  CsbD family protein  50 
 
 		 59 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  46.43 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  46.43 
 
 		 67 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4456  CsbD family protein  46.43 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.966914 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5653  CsbD family protein  46.43 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5381  CsbD family protein  42.59 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4561  CsbD family protein  48.08 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135073  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4070  CsbD family protein  43.75 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1596  hypothetical protein  47.27 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.446772  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  45.45 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2156  CsbD family protein  44.44 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.703881 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  42.31 
 
 		 55 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  42.31 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0941  CsbD family protein  47.62 
 
 		 64 aa  42.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455689 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  42.31 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3345  CsbD family protein  40.74 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.97311  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  44.23 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2052  CsbD family protein  38.6 
 
 		 61 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1628  CsbD family protein  38.46 
 
 		 55 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.462679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1328  CsbD family protein  46.15 
 
 		 59 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4149  hypothetical protein  35.09 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0600669  normal  0.0864277 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  39.29 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3861  CsbD family protein  46.15 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  40.38 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4068  CsbD family protein  46.15 
 
 		 59 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4905  CsbD family protein  39.29 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.5432  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  43.86 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4351  CsbD-like  43.64 
 
 		 63 aa  40  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4678  CsbD-like  41.07 
 
 		 60 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2010  CsbD-like  35.71 
 
 		 60 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000265907  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>