109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1668 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  100 
 
 		 57 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  82.46 
 
 		 57 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  78.57 
 
 		 57 aa  94  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  78.57 
 
 		 57 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6977  hypothetical protein  57.41 
 
 		 68 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1858  CsbD family protein  57.41 
 
 		 68 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  54.39 
 
 		 74 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  56.36 
 
 		 55 aa  61.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3194  CsbD family protein  50.91 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.828188  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0951  CsbD family protein  49.12 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3147  CsbD family protein  50.91 
 
 		 56 aa  58.2  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  50 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  50 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2107  CsbD family protein  49.09 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5644  CsbD family protein  40.35 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.905021  normal  0.970955 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2679  hypothetical protein  45.45 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  46.15 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  46.15 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5248  CsbD family protein  42.11 
 
 		 63 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489032  normal  0.455845 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3415  CsbD family protein  42.11 
 
 		 63 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1219  CsbD-like  45.45 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  47.06 
 
 		 62 aa  50.4  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5153  CsbD family protein  42.11 
 
 		 63 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.587859 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4048  CsbD family protein  43.86 
 
 		 63 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3263  CsbD family protein  51.79 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3473  CsbD family protein  42.11 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0071  CsbD family protein  50 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.839575  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4561  CsbD family protein  49.06 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  41.82 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1345  CsbD family protein  48.15 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3861  CsbD family protein  50.94 
 
 		 59 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  48.08 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236327 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  48.08 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0941  CsbD family protein  49.06 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455689 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  48.08 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1328  CsbD family protein  47.17 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4068  CsbD family protein  47.17 
 
 		 59 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4456  CsbD family protein  50 
 
 		 67 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.966914 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5653  CsbD family protein  50 
 
 		 67 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  50 
 
 		 71 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  45.45 
 
 		 61 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2139  CsbD family protein  45.45 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3655  hypothetical protein  42.31 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3424  hypothetical protein  42.31 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.963083  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3694  hypothetical protein  42.31 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367193  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3345  CsbD family protein  48 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.97311  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4184  CsbD family protein  44.23 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.432909 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3320  CsbD family protein  42.31 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525397  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2126  CsbD family protein  45.45 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0258887  normal  0.693221 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3743  hypothetical protein  42.31 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1574  hypothetical protein  42.31 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222818  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3644  hypothetical protein  42.31 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3066  CsbD family protein  46.15 
 
 		 58 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3114  CsbD family protein  44.23 
 
 		 59 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0661187 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3666  hypothetical protein  44.9 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0579437  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3385  hypothetical protein  40.38 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00837674  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6962  hypothetical protein  40 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2288  CsbD family protein  38.18 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3380  CsbD family protein  44.07 
 
 		 64 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.579569 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4486  CsbD family protein  41.51 
 
 		 60 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02330  CsbD-like stress response protein  46.15 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0752085  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2645  CsbD-like  40 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0240  CsbD family protein  41.82 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.630063 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4698  CsbD family protein  40 
 
 		 66 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328143  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1136  hypothetical protein  33.93 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00391813  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3456  CsbD family protein  42.31 
 
 		 56 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0288514 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3336  hypothetical protein  40.38 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3782  CsbD-like  44.23 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.45663  normal  0.0243288 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4993  CsbD family protein  42.31 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3578  CsbD family protein  48.08 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4727  CsbD family protein  40 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781625  hitchhiker  0.00687348 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4239  CsbD family protein  49.06 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.541601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2861  CsbD family protein  45.45 
 
 		 71 aa  42.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304574  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1645  CsbD family protein  43.64 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224689  normal  0.344043 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0295  CsbD family protein  37.74 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3574  CsbD family protein  50 
 
 		 58 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7336  CsbD family protein  36.84 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1847  CsbD family protein  43.64 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.373794  normal  0.439054 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3274  CsbD-like  34.55 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1079  CsbD-like  51.11 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0315456  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4568  CsbD family protein  54.76 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4905  CsbD family protein  44.23 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.5432  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  42.31 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1332  CsbD-like  46.15 
 
 		 60 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00134797  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4154  CsbD-like  38.18 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1698  CsbD family protein  38.6 
 
 		 69 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0307  CsbD family protein  44.23 
 
 		 60 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5383  CsbD family protein  36.36 
 
 		 114 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184351 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3988  CsbD-like  40 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2405  CsbD family protein  44.23 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.448422  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0923  hypothetical protein  40.38 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0908  hypothetical protein  40.38 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000630947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0891  hypothetical protein  40.38 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4351  CsbD-like  42.31 
 
 		 63 aa  40.8  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0987  hypothetical protein  40.38 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2201  hypothetical protein  44.23 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5381  CsbD family protein  41.18 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0616  CsbD family protein  43.4 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.396611  normal  0.591688 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1063  hypothetical protein  40.38 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4306299999999999e-37 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4077  CsbD-like  46.15 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>