39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3574 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3574  CsbD family protein  100 
 
 
58 aa  108  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3578  CsbD family protein  85.71 
 
 
57 aa  87.8  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3066  CsbD family protein  68.97 
 
 
58 aa  77.4  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3271  CsbD family protein  68.97 
 
 
58 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0195  CsbD family protein  66.07 
 
 
57 aa  72.8  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6483  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3681  CsbD family protein  62.07 
 
 
76 aa  71.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340646  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3456  CsbD family protein  62.5 
 
 
56 aa  65.5  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0288514 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4239  CsbD family protein  66.07 
 
 
57 aa  65.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.541601  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37400  CsbD-like protein  62.5 
 
 
57 aa  65.1  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0215657  normal  0.523967 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11610  CsbD-like protein  58.93 
 
 
58 aa  63.5  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.583154 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1078  CsbD family protein  63.46 
 
 
56 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3380  CsbD family protein  60.32 
 
 
64 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.579569 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0307  CsbD family protein  64.29 
 
 
60 aa  61.6  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5089  CsbD family protein  59.65 
 
 
57 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.634424 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4790  CsbD family protein  59.65 
 
 
57 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354066  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4704  CsbD-like protein  59.65 
 
 
57 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2561  CsbD family protein  51.79 
 
 
56 aa  57.4  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4993  CsbD family protein  53.57 
 
 
57 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3472  CsbD family protein  58.18 
 
 
58 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1217  CsbD family protein  55.36 
 
 
73 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0220  hypothetical protein  48.21 
 
 
64 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0200  CsbD family protein  48.21 
 
 
64 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  55.36 
 
 
67 aa  55.1  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3345  CsbD family protein  59.26 
 
 
65 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.97311  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3263  CsbD family protein  57.41 
 
 
76 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5110  CsbD family protein  52.63 
 
 
57 aa  53.9  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5162  CsbD family protein  53.57 
 
 
61 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4568  CsbD family protein  53.57 
 
 
64 aa  51.6  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3758  CsbD family protein  48.21 
 
 
64 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.398695  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3804  CsbD-like  46.43 
 
 
60 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.41973  normal  0.44749 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2222  CsbD family protein  48.15 
 
 
63 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0127575 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2052  CsbD family protein  48.21 
 
 
61 aa  47.4  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4913  CsbD family protein  44.83 
 
 
63 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.39688  normal  0.521476 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4070  CsbD family protein  50.88 
 
 
69 aa  45.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  48.08 
 
 
57 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  50 
 
 
57 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4678  CsbD-like  43.86 
 
 
60 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  46.15 
 
 
57 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0295  CsbD family protein  42.86 
 
 
69 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>