43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4678 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_4678  CsbD-like  100 
 
 
60 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3234  CsbD family protein  81.67 
 
 
60 aa  103  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.281578  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5261  hypothetical protein  71.67 
 
 
60 aa  88.2  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.197207 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4486  CsbD family protein  70 
 
 
60 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3271  CsbD family protein  66.67 
 
 
62 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.308977 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2010  CsbD-like  66.67 
 
 
60 aa  80.1  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000265907  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1403  hypothetical protein  62.5 
 
 
60 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.436132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0295  CsbD family protein  43.33 
 
 
69 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3345  CsbD family protein  49.06 
 
 
65 aa  47.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.97311  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2052  CsbD family protein  43.33 
 
 
61 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3472  CsbD family protein  44.83 
 
 
58 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3456  CsbD family protein  44.64 
 
 
56 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0288514 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5110  CsbD family protein  36.84 
 
 
57 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3194  CsbD family protein  41.51 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.828188  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  45 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  40.68 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4070  CsbD family protein  43.33 
 
 
69 aa  43.9  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3468  CsbD family protein  41.67 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517698  normal  0.22069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4704  CsbD-like protein  47.37 
 
 
57 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  44.23 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3578  CsbD family protein  44.64 
 
 
57 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4790  CsbD family protein  47.37 
 
 
57 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354066  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3147  CsbD family protein  41.51 
 
 
56 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5089  CsbD family protein  47.37 
 
 
57 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.634424 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1078  CsbD family protein  46.43 
 
 
56 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3574  CsbD family protein  43.86 
 
 
58 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05760  CsbD-like protein  35 
 
 
69 aa  42.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.309662  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  37.93 
 
 
62 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1217  CsbD family protein  42.86 
 
 
73 aa  41.6  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  38.98 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  38.98 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  38.89 
 
 
57 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11610  CsbD-like protein  36.21 
 
 
58 aa  41.2  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.583154 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4568  CsbD family protein  46.43 
 
 
64 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3066  CsbD family protein  42.11 
 
 
58 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  42.37 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0367  CsbD family protein  32.69 
 
 
127 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  42.37 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0307  CsbD family protein  40 
 
 
60 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0398  CsbD family protein  32.69 
 
 
127 aa  41.2  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  37.04 
 
 
57 aa  40.4  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4993  CsbD family protein  41.07 
 
 
57 aa  40  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1221  hypothetical protein  43.33 
 
 
67 aa  40  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000483184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>