11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3271 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3271  CsbD family protein  100 
 
 		 62 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.308977 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4678  CsbD-like  66.67 
 
 		 60 aa  84.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3234  CsbD family protein  66.67 
 
 		 60 aa  84  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.281578  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1403  hypothetical protein  69.64 
 
 		 60 aa  80.1  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.436132 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2010  CsbD-like  60 
 
 		 60 aa  76.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000265907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5261  hypothetical protein  56.67 
 
 		 60 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.197207 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4486  CsbD family protein  55 
 
 		 60 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0367  CsbD family protein  37.5 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0295  CsbD family protein  36.67 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3066  CsbD family protein  40.35 
 
 		 58 aa  41.6  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0398  CsbD family protein  35.42 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>