15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3468 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3468  CsbD family protein  100 
 
 		 135 aa  273  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517698  normal  0.22069 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5643  CsbD family protein  50 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4568  CsbD family protein  47.73 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  50 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4678  CsbD-like  41.67 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3456  CsbD family protein  43.18 
 
 		 56 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0288514 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1403  hypothetical protein  43.75 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.436132 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0951  CsbD family protein  44.19 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  36.73 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  35.09 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3914  CsbD family protein  45.95 
 
 		 116 aa  40  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  43.18 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2679  hypothetical protein  45 
 
 		 63 aa  40  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5248  CsbD family protein  47.5 
 
 		 63 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489032  normal  0.455845 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3415  CsbD family protein  47.5 
 
 		 63 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>