44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3914 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3914  CsbD family protein  100 
 
 		 116 aa  229  8.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1539  CsbD family protein  69.17 
 
 		 120 aa  157  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1055  CsbD family protein  44.83 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.120692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0395  CsbD family protein  44.64 
 
 		 113 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0364  CsbD family protein  44.64 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6962  hypothetical protein  40.71 
 
 		 122 aa  87.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3481  CsbD family protein  38.71 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258036  normal  0.179783 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5383  CsbD family protein  40.52 
 
 		 114 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184351 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0279  CsbD family protein  38.39 
 
 		 109 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6209  CsbD family protein  54.17 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5268  CsbD family protein  35.48 
 
 		 118 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5196  CsbD family protein  33.87 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401648 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4729  CsbD family protein  33.87 
 
 		 118 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2423  CsbD family protein  35.58 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2495  CsbD family protein  35.58 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.282407 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2718  CsbD family protein  35.58 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229668  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5643  CsbD family protein  33.93 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4458  CsbD family protein  33.94 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5651  CsbD family protein  33.94 
 
 		 167 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2220  hypothetical protein  46 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5985  hypothetical protein  46 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.425207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  39.34 
 
 		 67 aa  47  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2107  CsbD family protein  29.6 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  38.89 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2598  hypothetical protein  40.35 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.110866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3194  CsbD family protein  46.3 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.828188  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3147  CsbD family protein  46.3 
 
 		 56 aa  45.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1596  hypothetical protein  42.11 
 
 		 63 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.446772  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4351  CsbD-like  44.64 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2679  hypothetical protein  40.74 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  34.43 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  42.59 
 
 		 57 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02330  CsbD-like stress response protein  37.5 
 
 		 63 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0752085  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0071  CsbD family protein  36.84 
 
 		 63 aa  41.6  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.839575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4048  CsbD family protein  38.89 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  32.79 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  32.79 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  37.7 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  38.89 
 
 		 57 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3473  CsbD family protein  38.89 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5380  CsbD family protein  31.58 
 
 		 112 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2156  CsbD family protein  38.46 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.703881 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  38.89 
 
 		 55 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3468  CsbD family protein  45.95 
 
 		 135 aa  40  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517698  normal  0.22069 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>