91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3147 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009467  Acry_3194  CsbD family protein  100 
 
 		 101 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.828188  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3147  CsbD family protein  100 
 
 		 56 aa  105  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0951  CsbD family protein  58.18 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  56.36 
 
 		 74 aa  62.8  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  56.36 
 
 		 55 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  52.73 
 
 		 57 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6977  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1858  CsbD family protein  50 
 
 		 68 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  54.55 
 
 		 57 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  50.91 
 
 		 57 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  54.55 
 
 		 57 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1219  CsbD-like  52.73 
 
 		 72 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5644  CsbD family protein  49.09 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.905021  normal  0.970955 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  50 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2679  hypothetical protein  48.21 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3415  CsbD family protein  44.64 
 
 		 63 aa  50.1  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5248  CsbD family protein  44.64 
 
 		 63 aa  50.1  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489032  normal  0.455845 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4048  CsbD family protein  47.27 
 
 		 63 aa  50.1  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  48.08 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0941  CsbD family protein  48.21 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455689 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5153  CsbD family protein  45.45 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.587859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  48.08 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3336  hypothetical protein  47.17 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3473  CsbD family protein  43.64 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  49.02 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7336  CsbD family protein  47.27 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6962  hypothetical protein  42.86 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  45.45 
 
 		 61 aa  47.4  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5383  CsbD family protein  44.64 
 
 		 114 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184351 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4698  CsbD family protein  48.21 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328143  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3424  hypothetical protein  45.28 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.963083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3385  hypothetical protein  45.28 
 
 		 70 aa  47  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00837674  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3743  hypothetical protein  45.28 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1574  hypothetical protein  45.28 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222818  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3644  hypothetical protein  45.28 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3694  hypothetical protein  45.28 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367193  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3655  hypothetical protein  45.28 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3782  CsbD-like  47.17 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.45663  normal  0.0243288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  46.15 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3320  CsbD family protein  43.4 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525397  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3914  CsbD family protein  46.3 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1596  hypothetical protein  49.06 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.446772  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5653  CsbD family protein  48.08 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4456  CsbD family protein  48.08 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.966914 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4561  CsbD family protein  46.3 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4154  CsbD-like  44.64 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2060  CsbD-like  45.45 
 
 		 61 aa  44.7  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3666  hypothetical protein  45.28 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0579437  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  44.23 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  44.23 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1328  CsbD family protein  46.3 
 
 		 59 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1698  CsbD family protein  45.45 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4727  CsbD family protein  42.86 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781625  hitchhiker  0.00687348 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4068  CsbD family protein  46.3 
 
 		 59 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  44.23 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236327 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4351  CsbD-like  45.28 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2288  CsbD family protein  39.29 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0395  CsbD family protein  42.86 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3988  CsbD-like  42.86 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2718  CsbD family protein  41.07 
 
 		 110 aa  42.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229668  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3114  CsbD family protein  44.9 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0661187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0364  CsbD family protein  42.86 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2495  CsbD family protein  41.07 
 
 		 110 aa  42.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.282407 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4678  CsbD-like  41.51 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5650  hypothetical protein  57.14 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4459  hypothetical protein  57.14 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.922003 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3861  CsbD family protein  44.44 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4184  CsbD family protein  39.29 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.432909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6209  CsbD family protein  39.29 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2156  CsbD family protein  43.4 
 
 		 59 aa  42  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.703881 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1345  CsbD family protein  46.3 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3274  CsbD-like  40 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  40 
 
 		 61 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4486  CsbD family protein  35.19 
 
 		 60 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1539  CsbD family protein  42.86 
 
 		 120 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1055  CsbD family protein  41.07 
 
 		 113 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.120692 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5268  CsbD family protein  41.82 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2245  CsbD-like protein  41.07 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1194  CsbD-like  41.07 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2059  CsbD family protein  38.89 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2107  CsbD family protein  39.29 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0279  CsbD family protein  39.29 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5110  CsbD family protein  39.62 
 
 		 57 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2184  CsbD family protein  42 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1374  CsbD-like  43.64 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1578  CsbD family protein  38.89 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0515828  normal  0.510488 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1847  CsbD family protein  39.29 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.373794  normal  0.439054 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1394  CsbD-like  42.59 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1056  hypothetical protein  55.88 
 
 		 51 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.113483 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0394  hypothetical protein  58.33 
 
 		 51 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1136  hypothetical protein  30.91 
 
 		 65 aa  40  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00391813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>