41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1221 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1221  hypothetical protein  100 
 
 
67 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000483184  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0644  hypothetical protein  74.65 
 
 
76 aa  98.2  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.624559  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0649  hypothetical protein  78.69 
 
 
75 aa  92.4  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0408075  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1573  hypothetical protein  62.5 
 
 
75 aa  78.2  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0858  hypothetical protein  63.49 
 
 
71 aa  72  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.228547  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05760  CsbD-like protein  58.06 
 
 
69 aa  65.1  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.309662  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0833  hypothetical protein  52.63 
 
 
79 aa  57.8  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000181755  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1630  CsbD family protein  65.96 
 
 
65 aa  56.2  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0032  general stress response protein  69.77 
 
 
63 aa  51.2  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1136  hypothetical protein  48.33 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00391813  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  44.44 
 
 
67 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  44.44 
 
 
67 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1195  hypothetical protein  65.79 
 
 
62 aa  45.4  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.968971  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  44.44 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1317  hypothetical protein  42.19 
 
 
64 aa  45.1  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.121882  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1963  hypothetical protein  48.44 
 
 
67 aa  43.5  0.0009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.435104  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  43.75 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3320  CsbD family protein  44.07 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525397  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0068  hypothetical protein  37.7 
 
 
114 aa  42  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2052  CsbD family protein  42.62 
 
 
61 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4486  CsbD family protein  40 
 
 
60 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3336  hypothetical protein  43.55 
 
 
70 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  39.68 
 
 
67 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0279  CsbD family protein  40 
 
 
109 aa  41.2  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3456  CsbD family protein  42.86 
 
 
56 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0288514 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0071  CsbD family protein  44.26 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.839575  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3644  hypothetical protein  43.55 
 
 
70 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6209  CsbD family protein  37.7 
 
 
109 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3694  hypothetical protein  43.55 
 
 
70 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367193  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3424  hypothetical protein  43.55 
 
 
70 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.963083  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0364  CsbD family protein  45 
 
 
124 aa  40.8  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1716  CsbD family protein  44.44 
 
 
60 aa  40.4  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000823848  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3666  hypothetical protein  45.76 
 
 
67 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0579437  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0941  CsbD family protein  45.31 
 
 
64 aa  40.8  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455689 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1683  CsbD family protein  44.44 
 
 
60 aa  40.4  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000685848  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0395  CsbD family protein  45 
 
 
113 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1217  CsbD family protein  42.62 
 
 
73 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3655  hypothetical protein  47.27 
 
 
67 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3743  hypothetical protein  47.27 
 
 
70 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1574  hypothetical protein  47.27 
 
 
70 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222818  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4678  CsbD-like  43.33 
 
 
60 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>