21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1630 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1630  CsbD family protein  100 
 
 
65 aa  121  4e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0032  general stress response protein  67.8 
 
 
63 aa  76.3  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0644  hypothetical protein  63.83 
 
 
76 aa  56.6  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.624559  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1221  hypothetical protein  65.96 
 
 
67 aa  56.2  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000483184  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0858  hypothetical protein  59.18 
 
 
71 aa  53.9  0.0000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.228547  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0649  hypothetical protein  56 
 
 
75 aa  53.1  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0408075  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1573  hypothetical protein  59.57 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1136  hypothetical protein  56.82 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00391813  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0068  hypothetical protein  46.15 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05760  CsbD-like protein  52.17 
 
 
69 aa  43.5  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.309662  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3694  hypothetical protein  48.08 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367193  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3385  hypothetical protein  48.08 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00837674  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3424  hypothetical protein  48.08 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.963083  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3655  hypothetical protein  48.08 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3320  CsbD family protein  48.08 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525397  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3743  hypothetical protein  48.08 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1574  hypothetical protein  48.08 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222818  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3644  hypothetical protein  48.08 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3336  hypothetical protein  48.08 
 
 
70 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3666  hypothetical protein  45 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0579437  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3472  CsbD family protein  44.68 
 
 
58 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>