31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0649 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0649  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  137  6e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0408075  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1221  hypothetical protein  78.69 
 
 
67 aa  92.4  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000483184  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0644  hypothetical protein  62.69 
 
 
76 aa  85.9  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.624559  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1573  hypothetical protein  60 
 
 
75 aa  77.8  0.00000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0858  hypothetical protein  62.9 
 
 
71 aa  70.1  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.228547  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0833  hypothetical protein  52.7 
 
 
79 aa  64.7  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000181755  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05760  CsbD-like protein  58.93 
 
 
69 aa  57  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.309662  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1630  CsbD family protein  56 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1136  hypothetical protein  49.12 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00391813  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0032  general stress response protein  65.12 
 
 
63 aa  48.9  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0364  CsbD family protein  46.27 
 
 
124 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0395  CsbD family protein  46.27 
 
 
113 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6962  hypothetical protein  39.02 
 
 
122 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1195  hypothetical protein  54 
 
 
62 aa  43.5  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.968971  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1217  CsbD family protein  46.55 
 
 
73 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4729  CsbD family protein  37.18 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0279  CsbD family protein  38.81 
 
 
109 aa  42.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5196  CsbD family protein  37.18 
 
 
118 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.401648 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5268  CsbD family protein  37.68 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  43.94 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  43.94 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3263  CsbD family protein  39.19 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0295  CsbD family protein  41.18 
 
 
69 aa  41.6  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0240  CsbD family protein  38.89 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.630063 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6209  CsbD family protein  35.29 
 
 
109 aa  41.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0068  hypothetical protein  40 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3456  CsbD family protein  43.1 
 
 
56 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0288514 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4077  CsbD-like  43.08 
 
 
71 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3481  CsbD family protein  38.03 
 
 
125 aa  40.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258036  normal  0.179783 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4568  CsbD family protein  40.28 
 
 
64 aa  40.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2423  CsbD family protein  34.33 
 
 
110 aa  40  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>