47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3263 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3263  CsbD family protein  100 
 
 
76 aa  148  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0307  CsbD family protein  53.45 
 
 
60 aa  60.8  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3456  CsbD family protein  57.14 
 
 
56 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0288514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1217  CsbD family protein  50.88 
 
 
73 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3380  CsbD family protein  45.95 
 
 
64 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.579569 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5162  CsbD family protein  51.72 
 
 
61 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37400  CsbD-like protein  54.39 
 
 
57 aa  57.8  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0215657  normal  0.523967 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0195  CsbD family protein  54.39 
 
 
57 aa  57  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6483  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3472  CsbD family protein  54.39 
 
 
58 aa  55.1  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  49.21 
 
 
67 aa  54.3  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3574  CsbD family protein  57.41 
 
 
58 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3066  CsbD family protein  54.72 
 
 
58 aa  53.9  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11610  CsbD-like protein  52.63 
 
 
58 aa  53.5  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.583154 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3578  CsbD family protein  50.88 
 
 
57 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4993  CsbD family protein  50.88 
 
 
57 aa  52  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3345  CsbD family protein  46.77 
 
 
65 aa  52  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.97311  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5110  CsbD family protein  50 
 
 
57 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4568  CsbD family protein  46.77 
 
 
64 aa  51.2  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  50 
 
 
57 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  51.79 
 
 
57 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  50 
 
 
57 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3758  CsbD family protein  44.83 
 
 
64 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.398695  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4239  CsbD family protein  53.7 
 
 
57 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.541601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5089  CsbD family protein  46.43 
 
 
57 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.634424 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4790  CsbD family protein  46.43 
 
 
57 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354066  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4704  CsbD-like protein  46.43 
 
 
57 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3271  CsbD family protein  50.94 
 
 
58 aa  47.8  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2107  CsbD family protein  41.18 
 
 
126 aa  46.2  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  44.23 
 
 
57 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1078  CsbD family protein  46.15 
 
 
56 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2052  CsbD family protein  45.61 
 
 
61 aa  45.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1317  hypothetical protein  40 
 
 
64 aa  43.9  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.121882  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  41.07 
 
 
62 aa  43.9  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0833  hypothetical protein  35.94 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000181755  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  46 
 
 
55 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0941  CsbD family protein  45.61 
 
 
64 aa  42.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455689 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0649  hypothetical protein  39.19 
 
 
75 aa  42.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0408075  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2686  CsbD family protein  42.67 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0451307  normal  0.845965 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3681  CsbD family protein  40.74 
 
 
76 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340646  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05760  CsbD-like protein  44.83 
 
 
69 aa  40.8  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.309662  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  43.55 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  43.55 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  40.58 
 
 
67 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1858  CsbD family protein  39.62 
 
 
68 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6977  hypothetical protein  39.62 
 
 
68 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1963  hypothetical protein  41.07 
 
 
67 aa  40.4  0.008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.435104  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  40.74 
 
 
67 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.236327 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>