70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2423 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2423  CsbD family protein  100 
 
 		 110 aa  217  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2718  CsbD family protein  83.64 
 
 		 110 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229668  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2495  CsbD family protein  83.64 
 
 		 110 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.282407 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0279  CsbD family protein  72.64 
 
 		 109 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0395  CsbD family protein  68.47 
 
 		 113 aa  140  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1055  CsbD family protein  67.27 
 
 		 113 aa  140  8e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.120692 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0364  CsbD family protein  68.47 
 
 		 124 aa  139  9e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6209  CsbD family protein  71.58 
 
 		 109 aa  134  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5383  CsbD family protein  65.49 
 
 		 114 aa  124  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184351 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4458  CsbD family protein  45.45 
 
 		 167 aa  104  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5651  CsbD family protein  45.45 
 
 		 167 aa  104  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5268  CsbD family protein  52.14 
 
 		 118 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4729  CsbD family protein  51.28 
 
 		 118 aa  102  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3481  CsbD family protein  46.77 
 
 		 125 aa  101  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258036  normal  0.179783 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5196  CsbD family protein  50.43 
 
 		 118 aa  101  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6962  hypothetical protein  43.64 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1539  CsbD family protein  40.34 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3914  CsbD family protein  35.59 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  45.45 
 
 		 55 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0240  CsbD family protein  30.49 
 
 		 113 aa  50.4  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.630063 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4698  CsbD family protein  37.5 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328143  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  36.67 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2288  CsbD family protein  32.81 
 
 		 66 aa  47.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4184  CsbD family protein  35.94 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.432909 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1698  CsbD family protein  34.92 
 
 		 69 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  38.6 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  38.6 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4154  CsbD-like  30.77 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  38.6 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3988  CsbD-like  32.31 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3279  CsbD family protein  33.33 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4351  CsbD-like  37.29 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  45.1 
 
 		 62 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03817  protein YjbJ  33.33 
 
 		 63 aa  44.7  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0795  CsbD family protein  31.43 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  36.84 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1394  CsbD-like  32.31 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7336  CsbD family protein  33.33 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4905  CsbD family protein  40.35 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.5432  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  33.8 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6977  hypothetical protein  37.5 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2245  CsbD-like protein  30.65 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0616  CsbD family protein  36.84 
 
 		 63 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.396611  normal  0.591688 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1858  CsbD family protein  37.5 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4727  CsbD family protein  32.26 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781625  hitchhiker  0.00687348 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4825  hypothetical protein  38.67 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0379689  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5643  CsbD family protein  28.57 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4077  CsbD-like  39.66 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0071  CsbD family protein  39.66 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.839575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3274  CsbD-like  29.69 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  33.87 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2569  hypothetical protein  36.59 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1645  CsbD family protein  32.26 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.224689  normal  0.344043 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2679  hypothetical protein  40 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  39.34 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5380  CsbD family protein  31.25 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2645  CsbD-like  33.33 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2052  CsbD family protein  46 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0658  CsbD family protein  35.09 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5644  CsbD family protein  38.18 
 
 		 60 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.905021  normal  0.970955 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02330  CsbD-like stress response protein  35.59 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0752085  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2107  CsbD family protein  35.71 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2220  hypothetical protein  37.1 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3782  CsbD-like  33.9 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.45663  normal  0.0243288 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1731  CsbD-like  29.69 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.888491  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1596  hypothetical protein  34.48 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.446772  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0240  CsbD family protein  37.5 
 
 		 73 aa  40.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.9917 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4048  CsbD family protein  37.5 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0649  hypothetical protein  34.33 
 
 		 75 aa  40  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0408075  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1847  CsbD family protein  33.33 
 
 		 67 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.373794  normal  0.439054 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>