68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3782 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3782  CsbD-like  100 
 
 		 63 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.45663  normal  0.0243288 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1596  hypothetical protein  88.71 
 
 		 63 aa  103  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.446772  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4351  CsbD-like  85.71 
 
 		 63 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3861  CsbD family protein  77.59 
 
 		 59 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4068  CsbD family protein  77.59 
 
 		 59 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1328  CsbD family protein  77.59 
 
 		 59 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.253969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4561  CsbD family protein  75.86 
 
 		 59 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.135073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5653  CsbD family protein  75.81 
 
 		 67 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4456  CsbD family protein  75.81 
 
 		 67 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.966914 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1053  CsbD family protein  69.35 
 
 		 67 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.236327 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0397  CsbD family protein  69.35 
 
 		 67 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0366  CsbD family protein  69.35 
 
 		 67 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5381  CsbD family protein  65.57 
 
 		 67 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0480327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2156  CsbD family protein  72.41 
 
 		 59 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.703881 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  63.93 
 
 		 67 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  63.93 
 
 		 67 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  62.3 
 
 		 67 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  62.3 
 
 		 67 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0071  CsbD family protein  61.29 
 
 		 63 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.839575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  58.06 
 
 		 71 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1434  CsbD-like protein  60.71 
 
 		 60 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1332  CsbD-like  62.5 
 
 		 60 aa  68.2  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00134797  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0616  CsbD family protein  61.29 
 
 		 63 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.396611  normal  0.591688 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02330  CsbD-like stress response protein  53.97 
 
 		 63 aa  67.8  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0752085  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4905  CsbD family protein  56.45 
 
 		 71 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.5432  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0658  CsbD family protein  59.68 
 
 		 63 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4077  CsbD-like  55.56 
 
 		 71 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2201  hypothetical protein  52.38 
 
 		 71 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  54.84 
 
 		 71 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2997  CsbD-like protein  58.49 
 
 		 71 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1079  CsbD-like  56 
 
 		 71 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0315456  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  46.55 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2405  CsbD family protein  49.09 
 
 		 59 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.448422  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  53.85 
 
 		 55 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1345  CsbD family protein  47.17 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3862  CsbD family protein  39.68 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3320  CsbD family protein  50.98 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525397  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1384  CsbD family protein  44.83 
 
 		 59 aa  47.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3194  CsbD family protein  47.17 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.828188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3385  hypothetical protein  49.02 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00837674  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1574  hypothetical protein  49.02 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222818  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3644  hypothetical protein  49.02 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3743  hypothetical protein  49.02 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2036  CsbD family protein  43.1 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00282933  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3655  hypothetical protein  49.02 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3424  hypothetical protein  49.02 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.963083  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3694  hypothetical protein  49.02 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367193  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3147  CsbD family protein  47.17 
 
 		 56 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3666  hypothetical protein  49.02 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0579437  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1219  CsbD-like  48.08 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0951  CsbD family protein  42.31 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1668  CsbD family protein  44.23 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.839818  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0545  hypothetical protein  43.1 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2184  CsbD family protein  38.18 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5110  CsbD family protein  45.28 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5651  CsbD family protein  39.34 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3336  hypothetical protein  47.06 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4278  CsbD family protein  46.15 
 
 		 57 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  44.23 
 
 		 74 aa  42  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2861  CsbD family protein  38.33 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304574  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1353  CsbD family protein  46 
 
 		 71 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43261e-22 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0941  CsbD family protein  47.17 
 
 		 64 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455689 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1851  CsbD family protein  41.67 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.668658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0717  CsbD family protein  42.31 
 
 		 57 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2423  CsbD family protein  33.9 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2561  CsbD family protein  41.82 
 
 		 56 aa  40.8  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08871  CsbD-like protein  41.18 
 
 		 61 aa  40.4  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.919038  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  40.38 
 
 		 57 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>