58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1055 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1055  CsbD family protein  100 
 
 		 113 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.120692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0395  CsbD family protein  81.42 
 
 		 113 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0364  CsbD family protein  80.53 
 
 		 124 aa  176  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5383  CsbD family protein  72.97 
 
 		 114 aa  136  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.184351 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0279  CsbD family protein  63.72 
 
 		 109 aa  130  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2423  CsbD family protein  65.66 
 
 		 110 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2495  CsbD family protein  65.66 
 
 		 110 aa  121  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.282407 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2718  CsbD family protein  65.66 
 
 		 110 aa  121  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229668  normal  0.19415 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6209  CsbD family protein  67.26 
 
 		 109 aa  120  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4458  CsbD family protein  49.08 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5651  CsbD family protein  49.08 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.148374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3481  CsbD family protein  57.02 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.258036  normal  0.179783 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5268  CsbD family protein  57.02 
 
 		 118 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4729  CsbD family protein  56.14 
 
 		 118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5196  CsbD family protein  55.26 
 
 		 118 aa  114  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401648 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6962  hypothetical protein  45.87 
 
 		 122 aa  103  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1539  CsbD family protein  46.55 
 
 		 120 aa  94  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3914  CsbD family protein  44.83 
 
 		 116 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4825  hypothetical protein  45.07 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0379689  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0184  hypothetical protein  49.18 
 
 		 261 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4163  hypothetical protein  45.9 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2569  hypothetical protein  42.42 
 
 		 112 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.102357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  47.27 
 
 		 55 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2107  CsbD family protein  31.4 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4698  CsbD family protein  37.1 
 
 		 66 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328143  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  38.33 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5380  CsbD family protein  30.28 
 
 		 112 aa  47  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  38.6 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  38.6 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  36.84 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4455  CsbD family protein  35.63 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1394  CsbD-like  33.33 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  36.36 
 
 		 74 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  38.6 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7336  CsbD family protein  33.33 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0240  CsbD family protein  26.37 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.630063 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5643  CsbD family protein  29.36 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6977  hypothetical protein  39.29 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3194  CsbD family protein  40.35 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.828188  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2288  CsbD family protein  31.67 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1052  CsbD family protein  30.08 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.250631 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2220  hypothetical protein  42.59 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1698  CsbD family protein  31.75 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1858  CsbD family protein  39.29 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4154  CsbD-like  29.03 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2245  CsbD-like protein  29.03 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0795  CsbD family protein  34.29 
 
 		 73 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3988  CsbD-like  30.65 
 
 		 69 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03817  protein YjbJ  35.59 
 
 		 63 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24770  hypothetical protein  31.52 
 
 		 109 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3147  CsbD family protein  41.07 
 
 		 56 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2098  hypothetical protein  31.52 
 
 		 109 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4184  CsbD family protein  33.33 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.432909 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4905  CsbD family protein  39.29 
 
 		 71 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.5432  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3279  CsbD family protein  33.33 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4351  CsbD-like  35.59 
 
 		 63 aa  40.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1219  CsbD-like  41.51 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  36.07 
 
 		 71 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>