53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1052 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_1052  CsbD family protein  100 
 
 		 127 aa  242  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.250631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0367  CsbD family protein  88.19 
 
 		 127 aa  205  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0398  CsbD family protein  88.19 
 
 		 127 aa  204  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4455  CsbD family protein  77.1 
 
 		 131 aa  170  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5380  CsbD family protein  58.27 
 
 		 112 aa  130  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2095  hypothetical protein  48.87 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0740  CsbD family protein  49.25 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2135  hypothetical protein  45.26 
 
 		 138 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.365647  normal  0.468753 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2412  hypothetical protein  44.53 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.152283 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3352  hypothetical protein  40.68 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1145  CsbD family protein  38.98 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5331  CsbD family protein  35.48 
 
 		 65 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107466 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1550  CsbD family protein  37.1 
 
 		 62 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0886434  normal  0.217022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1879  CsbD family protein  37.1 
 
 		 62 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5643  CsbD family protein  41.67 
 
 		 80 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2107  CsbD family protein  36.8 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  37.93 
 
 		 61 aa  48.9  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2126  CsbD family protein  32.2 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0258887  normal  0.693221 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  38.6 
 
 		 61 aa  47.4  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2139  CsbD family protein  32.2 
 
 		 109 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756124  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1731  CsbD-like  34.55 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.888491  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3710  CsbD family protein  39.29 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2910  hypothetical protein  32.91 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.912456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1539  CsbD family protein  34.15 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1037  CsbD-like protein  35 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.450936  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5008  putative stress response protein  35.71 
 
 		 67 aa  44.7  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594751  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5653  CsbD family protein  33.9 
 
 		 59 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3387  CsbD family protein  37.5 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1196  CsbD-like  34.55 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1194  CsbD-like  34.55 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1055  CsbD family protein  30.08 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.120692 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2651  CsbD-like protein  32.73 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0795  CsbD family protein  36.21 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3279  CsbD family protein  35.71 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2645  CsbD-like  37.93 
 
 		 61 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1855  CsbD family protein  36.36 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.268562  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1940  CsbD family protein  36.36 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2023  CsbD-like protein  36.36 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0249  putative stress-response protein  34.55 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.430539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1578  CsbD family protein  31.67 
 
 		 82 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0515828  normal  0.510488 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0240  CsbD family protein  33.93 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.630063 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03817  protein YjbJ  34.55 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1706  CsbD family protein  37.74 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0926175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0240  CsbD family protein  38.33 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.9917 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1575  CsbD-like  40 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5280  CsbD-like  36.54 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5578  CsbD family protein  36.54 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.675487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0316  CsbD family protein  27.42 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.179189  hitchhiker  0.0000000572285 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0848  CsbD family protein  38.18 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00395156  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2059  CsbD family protein  31.67 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  29.63 
 
 		 74 aa  40.8  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3681  CsbD family protein  31.67 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3505  CsbD-like  35.71 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00399435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>