40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5653 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_5653  CsbD family protein  100 
 
 		 59 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5331  CsbD family protein  61.02 
 
 		 65 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107466 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1689  CsbD family protein  60.71 
 
 		 57 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.368224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1145  CsbD family protein  66.67 
 
 		 63 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3352  hypothetical protein  64.71 
 
 		 63 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1550  CsbD family protein  52.54 
 
 		 62 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0886434  normal  0.217022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1879  CsbD family protein  52.54 
 
 		 62 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5578  CsbD family protein  39.29 
 
 		 67 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.675487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5280  CsbD-like  39.29 
 
 		 67 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  45.45 
 
 		 61 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  45.61 
 
 		 61 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2060  CsbD-like  45.45 
 
 		 61 aa  50.4  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3895  CsbD family protein  37.5 
 
 		 58 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1706  CsbD family protein  37.5 
 
 		 58 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0926175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2645  CsbD-like  41.82 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0398  CsbD family protein  35.59 
 
 		 127 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3274  CsbD-like  43.64 
 
 		 69 aa  47  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0941  CsbD family protein  43.86 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455689 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0367  CsbD family protein  33.9 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1052  CsbD family protein  33.9 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.250631 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0165  hypothetical protein  38.89 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1219  CsbD-like  40 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  38.18 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0279  CsbD family protein  37.5 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5644  CsbD family protein  48.78 
 
 		 60 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.905021  normal  0.970955 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2156  CsbD family protein  40 
 
 		 59 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.703881 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  44.23 
 
 		 71 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1786  CsbD family protein  35.71 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30394  normal  0.432294 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3320  CsbD family protein  37.74 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525397  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4455  CsbD family protein  33.33 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2679  hypothetical protein  35.71 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3385  hypothetical protein  34.55 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00837674  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1578  CsbD family protein  38 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0515828  normal  0.510488 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3655  hypothetical protein  34.55 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2412  CsbD family protein  38.18 
 
 		 59 aa  40.4  0.009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.324054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3694  hypothetical protein  34.55 
 
 		 70 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.367193  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3743  hypothetical protein  35.85 
 
 		 70 aa  40  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1574  hypothetical protein  35.85 
 
 		 70 aa  40  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.222818  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3644  hypothetical protein  34.55 
 
 		 70 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3424  hypothetical protein  34.55 
 
 		 70 aa  40  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.963083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>