43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1689 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1689  CsbD family protein  100 
 
 		 57 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.368224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1879  CsbD family protein  72.73 
 
 		 62 aa  80.5  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1550  CsbD family protein  72.73 
 
 		 62 aa  80.5  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0886434  normal  0.217022 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5331  CsbD family protein  70.91 
 
 		 65 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0107466 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1145  CsbD family protein  67.27 
 
 		 63 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5653  CsbD family protein  60.71 
 
 		 59 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3352  hypothetical protein  63.64 
 
 		 63 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2645  CsbD-like  57.89 
 
 		 61 aa  58.5  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  52.63 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1786  CsbD family protein  46.43 
 
 		 70 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30394  normal  0.432294 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2060  CsbD-like  49.12 
 
 		 61 aa  50.4  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3274  CsbD-like  49.12 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0165  hypothetical protein  44.64 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1706  CsbD family protein  37.5 
 
 		 58 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0926175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5280  CsbD-like  37.5 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5578  CsbD family protein  37.5 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.675487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1578  CsbD family protein  39.29 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0515828  normal  0.510488 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3279  CsbD family protein  45.61 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3895  CsbD family protein  41.07 
 
 		 58 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2156  CsbD family protein  47.17 
 
 		 59 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.703881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2059  CsbD family protein  38.89 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3681  CsbD family protein  38.89 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  45.45 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1940  CsbD family protein  36.84 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3473  CsbD family protein  43.86 
 
 		 59 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1855  CsbD family protein  36.84 
 
 		 68 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.268562  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  46.3 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4351  CsbD-like  45.28 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2412  CsbD family protein  40.35 
 
 		 59 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.324054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2023  CsbD-like protein  36.84 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2107  CsbD family protein  40.35 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1219  CsbD-like  38.6 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2159  hypothetical protein  44 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.876474 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4077  CsbD-like  48.08 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  46.15 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0941  CsbD family protein  42.86 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455689 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3352  hypothetical protein  38.18 
 
 		 55 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3385  hypothetical protein  42.31 
 
 		 70 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00837674  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2139  CsbD family protein  41.82 
 
 		 109 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756124  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3572  CsbD-like  38.18 
 
 		 65 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2126  CsbD family protein  41.82 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0258887  normal  0.693221 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2679  hypothetical protein  37.5 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1860  CsbD family protein  33.33 
 
 		 71 aa  40.4  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0325591  normal  0.0799558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>