91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1860 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1860  CsbD family protein  100 
 
 		 71 aa  142  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0325591  normal  0.0799558 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0316  CsbD family protein  44.07 
 
 		 67 aa  63.9  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.179189  hitchhiker  0.0000000572285 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0515  putative stress-response protein  48.08 
 
 		 69 aa  57.8  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0604  protein YjbJ  36.92 
 
 		 65 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4008  CsbD-like  40.32 
 
 		 65 aa  55.5  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0235729  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3505  CsbD-like  43.4 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00399435  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3610  CsbD family protein  40.32 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0252527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0274  CsbD-like protein  37.88 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0152084  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5008  putative stress response protein  43.4 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594751  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1196  CsbD-like  37.7 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1194  CsbD-like  37.7 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4583  putative stress-response protein  45.83 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.808019 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4634  putative stress-response protein  45.83 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.27716 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4497  putative stress-response protein  45.83 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4432  putative stress-response protein  45.83 
 
 		 69 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000026393 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4458  putative stress-response protein  44.23 
 
 		 69 aa  53.5  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4582  putative stress-response protein  45.83 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5526  putative stress-response protein  38.24 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.289766  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3948  CsbD family protein  38.24 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03877  hypothetical protein  38.24 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4285  putative stress-response protein  38.24 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4598  putative stress-response protein  38.24 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3983  putative stress-response protein  38.24 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.216116 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4507  putative stress-response protein  45.83 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4552  putative stress-response protein  38.24 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03917  predicted stress response protein  38.24 
 
 		 69 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4053  CsbD family protein  47.92 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5157  CsbD family protein  45.83 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.461612 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1731  CsbD-like  39.68 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.888491  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3468  CsbD family protein  47.92 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1175  CsbD-like  33.87 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.577345  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0249  putative stress-response protein  45.83 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.430539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2699  CsbD family protein  38.71 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.90696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2250  hypothetical protein  36.76 
 
 		 71 aa  51.6  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2683  hypothetical protein  45.83 
 
 		 65 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3602  CsbD family protein  35.38 
 
 		 65 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.257437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1092  hypothetical protein  37.31 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3387  CsbD family protein  40.74 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3710  CsbD family protein  41.51 
 
 		 67 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2202  CsbD-like  35.94 
 
 		 65 aa  51.2  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2503  CsbD-like  39.71 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0483582  normal  0.747917 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3411  CsbD family protein  43.75 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5243  CsbD family protein  43.75 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.723019 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1394  CsbD-like  31.82 
 
 		 67 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.915211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0240  CsbD family protein  35.38 
 
 		 73 aa  50.4  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.9917 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1391  CsbD family protein  42.42 
 
 		 70 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2651  CsbD-like protein  36.07 
 
 		 68 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4184  CsbD family protein  30.77 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.432909 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0848  CsbD family protein  35.82 
 
 		 68 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00395156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1152  CsbD-like  42.31 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6641  CsbD family protein  32.31 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000497108 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1374  CsbD-like  32.26 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.361171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2491  CsbD family protein  30.3 
 
 		 68 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.853638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1771  CsbD family protein  40.38 
 
 		 77 aa  47  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2892  CsbD family protein  37.31 
 
 		 68 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327354  normal  0.0609409 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5455  hypothetical protein  30.77 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21937  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4727  CsbD family protein  35.19 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.781625  hitchhiker  0.00687348 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62680  hypothetical protein  30.77 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0156  hypothetical protein  36.54 
 
 		 67 aa  47  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.232255  hitchhiker  0.0000211903 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08871  CsbD-like protein  34.48 
 
 		 61 aa  45.4  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.919038  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1270  hypothetical protein  33.87 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.390747  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0055  CsbD family protein  35.48 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.587208 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  37.74 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2928  CsbD family protein  33.87 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0166  CsbD-like  36.54 
 
 		 67 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.115396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2910  hypothetical protein  41.67 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.912456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0852  CsbD family protein  38.46 
 
 		 73 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0249  CsbD family protein  36.54 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.806241  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0254  CsbD family protein  36.54 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0514063 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3572  CsbD-like  29.23 
 
 		 65 aa  44.3  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3352  hypothetical protein  34.62 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4698  CsbD family protein  27.27 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.328143  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1037  CsbD-like protein  38.46 
 
 		 65 aa  44.3  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.450936  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0795  CsbD family protein  36.54 
 
 		 73 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03817  protein YjbJ  30.16 
 
 		 63 aa  43.9  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7336  CsbD family protein  27.27 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2319  CsbD family protein  34.43 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02853  hypothetical protein  29.41 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1145  CsbD family protein  34.62 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1575  CsbD-like  30.3 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1847  CsbD family protein  32.2 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.373794  normal  0.439054 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6005  hypothetical protein  34.62 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2262  CsbD family protein  30.16 
 
 		 71 aa  41.2  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.860427  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1858  CsbD family protein  33.96 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3584  hypothetical protein  33.93 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2288  CsbD family protein  25.76 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6977  hypothetical protein  33.96 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1689  CsbD family protein  33.33 
 
 		 57 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.368224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0312  CsbD family protein  33.33 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1851  CsbD family protein  32.79 
 
 		 61 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.668658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1698  CsbD family protein  27.12 
 
 		 69 aa  40  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>