39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3473 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3473  CsbD family protein  100 
 
 		 59 aa  111  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3279  CsbD family protein  80.7 
 
 		 61 aa  90.9  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2412  CsbD family protein  72.88 
 
 		 59 aa  87.8  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.324054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3274  CsbD-like  65.52 
 
 		 69 aa  77  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2139  CsbD family protein  55.93 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756124  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1602  CsbD-like  64.91 
 
 		 61 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00164286  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2645  CsbD-like  61.4 
 
 		 61 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2126  CsbD family protein  54.24 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0258887  normal  0.693221 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5643  CsbD family protein  53.06 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.595165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1879  CsbD family protein  44.64 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1550  CsbD family protein  44.64 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0886434  normal  0.217022 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3572  CsbD-like  43.86 
 
 		 65 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1353  CsbD-like  43.64 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.858487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2337  hypothetical protein  60.61 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.042061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2184  CsbD family protein  39.62 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1689  CsbD family protein  43.86 
 
 		 57 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.368224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2060  CsbD-like  44.07 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6962  hypothetical protein  38.6 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.152901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2405  CsbD family protein  43.14 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.448422  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3352  hypothetical protein  42.37 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4501  CsbD family protein  40 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.355714  normal  0.0289282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2201  hypothetical protein  41.82 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3663  hypothetical protein  42.86 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1145  CsbD family protein  42.37 
 
 		 63 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2096  CsbD family protein  40 
 
 		 67 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4225  CsbD-like  41.51 
 
 		 71 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2041  CsbD-like protein  36.36 
 
 		 74 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2136  CsbD family protein  40 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.255904  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0086  CsbD family protein  36.36 
 
 		 57 aa  41.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0727679  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2413  CsbD family protein  40 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5008  putative stress response protein  41.07 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.594751  normal  0.613713 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2023  CsbD-like protein  38.46 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0604  protein YjbJ  40.38 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2059  CsbD family protein  40.82 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1706  CsbD family protein  30.91 
 
 		 58 aa  40.4  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0926175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4455  CsbD family protein  35.71 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845381  normal  0.999867 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  44.44 
 
 		 67 aa  40  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62680  hypothetical protein  40.38 
 
 		 65 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5455  hypothetical protein  40.38 
 
 		 65 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>